RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373433.8

RPRD1B-201, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPRD1B, Length 3,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-201ENST00000373433 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 Q8IYB0 196 aa9.27□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM215AQ9Y5M1 114 aa9.27□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 DYSFO75923 2080 aa9.27□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 PKD1L2Q7Z442 2459 aa9.27□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 J3QT63 122 aa9.27□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 TFF1P04155 84 aa9.27□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 ESDP10768 282 aa9.27□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 RPL31P62899 125 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 SMIM15Q7Z3B0 74 aa9.27□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 Q8N976 141 aa9.27□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 TPPP3Q9BW30 176 aa9.27□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa9.27□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 PSG7Q13046 419 aa9.27□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 KCNS1Q96KK3 526 aa9.27□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 TRAV24A0A0B4J272 114 aa9.26□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 IGLV2-14P01704 120 aa9.26□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 Q0VG73 95 aa9.26□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 FXYD3Q14802 87 aa9.26□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 Q56UQ5 140 aa9.26□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 A0A1W2PS18 150 aa9.26□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM90A26D6RGX4 464 aa9.26□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 RAB31Q13636 194 aa9.26□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa9.26□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 HSPB7Q9UBY9 170 aa9.26□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 K7EP13 123 aa9.26□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 NDUFB3O43676 98 aa9.26□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 S1PR2O95136 353 aa9.26□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 CD40P25942 277 aa9.26□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF596Q8TC21 504 aa9.26□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 SPOCK3Q9BQ16 436 aa9.26□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa9.25□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 K7EN84 100 aa9.25□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 RPL19P84098 196 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 CCL13Q99616 98 aa9.25□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 OR2D2Q9H210 308 aa9.25□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa9.25□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa9.25□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 RELBQ01201 579 aa9.25□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 SSMEM1Q8WWF3 244 aa9.25□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 S1PR3Q99500 378 aa9.25□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa9.25□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 RNF212BA8MTL3 300 aa9.25□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 J3QW42 95 aa9.25□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 CD1BP29016 333 aa9.25□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 GLRXP35754 106 aa9.25□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 MPV17P39210 176 aa9.25□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 MIC13Q5XKP0 118 aa9.25□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 SSX8Q7RTT4 187 aa9.25□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 CHODLQ9H9P2 273 aa9.25□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 DKK4Q9UBT3 224 aa9.25□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa9.24□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM8BA6NDV4 472 aa9.24□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 TOMM40O96008 361 aa9.24□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 COL8A2P25067 703 aa9.24□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 OR2V2Q96R30 315 aa9.24□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 COMMD5Q9GZQ3 224 aa9.24□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 TP73-AS1Q9UF72 201 aa9.24□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 APOA2P02652 100 aa9.24□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 PRRX1P54821 245 aa9.24□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 BSPH1Q075Z2 132 aa9.24□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 ACANP16112 2415 aa9.24□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa9.24□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 RHBDL1O75783 438 aa9.24□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 CA2P00918 260 aa9.24□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 ITLN1Q8WWA0 313 aa9.24□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 PMS2P5A8MQ11 134 aa9.23□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 RRHO14718 337 aa9.23□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 WNT9BO14905 357 aa9.23□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 HSBP1O75506 76 aa9.23□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 CLDN14O95500 239 aa9.23□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 MS4A5Q9H3V2 200 aa9.23□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 LINC00205P59089 165 aa9.23□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 RPL30P62888 115 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 Q8NFD4 153 aa9.23□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 OR2D3Q8NGH3 330 aa9.23□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 CLEC7AQ9BXN2 247 aa9.23□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC25A15Q9Y619 301 aa9.23□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 FRYQ5TBA9 3013 aa9.23□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 CXorf1O96002 111 aa9.23□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 MGST1P10620 155 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 PSG1P11464 419 aa9.23□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 CA7P43166 264 aa9.23□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 LRRC10Q5BKY1 277 aa9.23□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 OR4A47Q6IF82 309 aa9.23□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 Q8NA96 180 aa9.23□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 GNB1LQ9BYB4 327 aa9.23□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa9.22□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 WDR73Q6P4I2 378 aa9.22□□□□□ -0.93
RPRD1B-201ENST00000373433 NIT1Q86X76 327 aa9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.5 ms