RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369864.4

AMIGO1-202, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMIGO1, Length 5,088 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-202ENST00000369864 PCOLCEQ15113 449 aa15.61■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF585BQ52M93 769 aa15.61■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 FADS6Q8N9I5 356 aa15.6■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC25A45Q8N413 288 aa15.6■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa15.6■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 DYNLRB2Q8TF09 96 aa15.6■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 A8MWP6 167 aa15.6■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa15.6■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 COX6A1P12074 109 aa15.6■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 MAJINQ3KP22 176 aa15.6■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 DCTN5Q9BTE1 182 aa15.6■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF319Q9P2F9 582 aa15.6■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 PF4V1P10720 104 aa15.6■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa15.59■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 TMEM262E9PQX1 116 aa15.59■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 NPPCP23582 126 aa15.59■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 SELENOKQ9Y6D0 94 aa15.59■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 UBE2L6O14933 153 aa15.59■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 CD33P20138 364 aa15.59■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 EFNB3Q15768 340 aa15.59■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 RFNGQ9Y644 331 aa15.59■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 TMEM95Q3KNT9 176 aa15.59■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 LYZL4Q96KX0 146 aa15.59■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 CRIM1Q9NZV1 1036 aa15.59■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 CTSSP25774 331 aa15.59■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 SCN8AQ9UQD0 1980 aa15.58■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 WNK3Q9BYP7 1800 aa15.58■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM181BA6NEQ2 426 aa15.58■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 GAGE13Q4V321 117 aa15.58■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 MPV17L2Q567V2 206 aa15.58■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 COQ2Q96H96 371 aa15.58■□□□□ 0.09
AMIGO1-202ENST00000369864 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa15.58■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa15.58■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 EPDR1Q9UM22 224 aa15.58■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 AHRRA9YTQ3 701 aa15.58■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 RAMP3O60896 148 aa15.58■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 LCN12Q6JVE5 192 aa15.58■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 DPM2O94777 84 aa15.58■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM159AQ6UWV7 190 aa15.58■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 TSKUQ8WUA8 353 aa15.58■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 DDB2Q92466 427 aa15.58■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 C3orf79P0CE67 100 aa15.57■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 LOXL4Q96JB6 756 aa15.57■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 VKORC1Q9BQB6 163 aa15.57■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa15.57■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 A0A0G2JLM5 398 aa15.57■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 PPIAL4GP0DN37 164 aa15.57■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 FOXC1Q12948 553 aa15.57■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 CLEC7AQ9BXN2 247 aa15.57■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 CDCP2Q5VXM1 449 aa15.57■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 PYYP10082 97 aa15.56■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 CKS1BP61024 79 aa15.56■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 OR9G4Q8NGQ1 327 aa15.56■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 LINC00271P0C7V0 271 aa15.56■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 IGHV2-70P01814 119 aa15.56■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 IFI27L1Q96BM0 104 aa15.56■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 SLX1AQ9BQ83 275 aa15.56■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 OTORQ9NRC9 128 aa15.56■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 MOB4Q9Y3A3 225 aa15.56■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 CHD5Q8TDI0 1954 aa15.56■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 OR13C6PQ8NH95 151 aa15.56■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 SHISA5Q8N114 240 aa15.55■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 DMRTA2Q96SC8 542 aa15.55■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa15.55■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 C9JQL5 133 aa15.55■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 RFPL3SP0C7P2 107 aa15.55■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 PILRBQ9UKJ0 227 aa15.55■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 HGFACQ04756 655 aa15.55■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 WBP1Q96G27 269 aa15.55■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 ANKRD36A6QL64 1941 aa15.55■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa15.54■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 A8MWV9 139 aa15.54■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 ASIPP42127 132 aa15.54■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 NRN1LQ496H8 165 aa15.54■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 GTSF1LQ9H1H1 148 aa15.54■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 CYSLTR1Q9Y271 337 aa15.54■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 S4R3C0 116 aa15.54■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa15.54■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 EPOPA6NHQ4 379 aa15.54■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 PSG1P11464 419 aa15.54■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM166AQ6J272 317 aa15.54■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 OR5AN1Q8NGI8 311 aa15.54■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 AGMATQ9BSE5 352 aa15.54■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 C15orf61A6NNL5 157 aa15.54■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 C9JCJ5 164 aa15.54■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 ERVK11-1P61568 191 aa15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.5 ms