RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 TRAPPC13A5PLN9 417 aa3.66□□□□□ -1.82
MDM2-201ENST00000258148 SH2D1AO60880 128 aa3.66□□□□□ -1.82
MDM2-201ENST00000258148 MSNP26038 577 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
MDM2-201ENST00000258148 TSPEAR-AS2P59090 65 aa3.66□□□□□ -1.82
MDM2-201ENST00000258148 CST6Q15828 149 aa3.66□□□□□ -1.82
MDM2-201ENST00000258148 TMPPEQ6ZT21 453 aa3.66□□□□□ -1.82
MDM2-201ENST00000258148 OR13C8Q8NGS7 320 aa3.66□□□□□ -1.82
MDM2-201ENST00000258148 OR10K1Q8NGX5 313 aa3.66□□□□□ -1.82
MDM2-201ENST00000258148 OR4K13Q8NH42 304 aa3.66□□□□□ -1.82
MDM2-201ENST00000258148 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
MDM2-201ENST00000258148 TRANK1O15050 2925 aa3.66□□□□□ -1.82
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MDM2-201ENST00000258148 C11orf1Q9H5F2 150 aa3.65□□□□□ -1.82
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MDM2-201ENST00000258148 DMDP11532 3685 aa3.65□□□□□ -1.83
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MDM2-201ENST00000258148 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa3.64□□□□□ -1.83
MDM2-201ENST00000258148 DAND5Q8N907 189 aa3.64□□□□□ -1.83
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MDM2-201ENST00000258148 HIST1H2BAQ96A08 127 aa3.64□□□□□ -1.83
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MDM2-201ENST00000258148 VCXQ9H320 206 aa3.64□□□□□ -1.83
MDM2-201ENST00000258148 PRO3102Q9H379 93 aa3.64□□□□□ -1.83
MDM2-201ENST00000258148 BATF3Q9NR55 127 aa3.64□□□□□ -1.83
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MDM2-201ENST00000258148 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa3.64□□□□□ -1.83
MDM2-201ENST00000258148 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa3.63□□□□□ -1.83
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MDM2-201ENST00000258148 CPMP14384 443 aa3.63□□□□□ -1.83
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MDM2-201ENST00000258148 TMEM69Q5SWH9 247 aa3.63□□□□□ -1.83
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MDM2-201ENST00000258148 FBXL12Q9NXK8 326 aa3.63□□□□□ -1.83
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MDM2-201ENST00000258148 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa3.63□□□□□ -1.83
MDM2-201ENST00000258148 A8MT66 165 aa3.63□□□□□ -1.83
MDM2-201ENST00000258148 BET1O15155 118 aa3.63□□□□□ -1.83
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MDM2-201ENST00000258148 C20orf27Q9GZN8 174 aa3.63□□□□□ -1.83
MDM2-201ENST00000258148 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
MDM2-201ENST00000258148 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
MDM2-201ENST00000258148 MED29Q9NX70 200 aa3.63□□□□□ -1.83
MDM2-201ENST00000258148 AGRNO00468 2067 aa3.62□□□□□ -1.83
MDM2-201ENST00000258148 SVILO95425 2214 aa3.62□□□□□ -1.83
MDM2-201ENST00000258148 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa3.62□□□□□ -1.83
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