RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617055.4

UBE2C-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene UBE2C, Length 705 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-208ENST00000617055 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa13.08□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 PDCD5O14737 125 aa13.08□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 DFFBO76075 338 aa13.08□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 MSMO1Q15800 293 aa13.08□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 STHQ8IWL8 128 aa13.08□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 CD5P06127 495 aa13.07□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 CATR1Q13166 79 aa13.07□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 TMEM41BQ5BJD5 291 aa13.07□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 OR1L8Q8NGR8 309 aa13.07□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 GIMAP1Q8WWP7 306 aa13.07□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 NDUFAF3Q9BU61 184 aa13.07□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 HINT2Q9BX68 163 aa13.07□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 MS4A6AQ9H2W1 248 aa13.07□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 ACOT13Q9NPJ3 140 aa13.07□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa13.07□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 X6R8D5 127 aa13.07□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 HERC1Q15751 4861 aa13.07□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 TMEM235A6NFC5 223 aa13.06□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 C12orf74Q32Q52 190 aa13.06□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF773Q6PK81 442 aa13.06□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 FAM24BQ8N5W8 94 aa13.06□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 ZBTB34Q8NCN2 500 aa13.06□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 OR13F1Q8NGS4 319 aa13.06□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 PLEKHA2Q9HB19 425 aa13.06□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 SCN3BQ9NY72 215 aa13.06□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa13.05□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 FCGR2CP31995 323 aa13.05□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF767PQ75MW2 155 aa13.05□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 ST8SIA2Q92186 375 aa13.05□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 CELA1Q9UNI1 258 aa13.05□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 TRAV2A0A0B4J234 112 aa13.04□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 ST8SIA3O43173 380 aa13.04□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 SSX5O60225 188 aa13.04□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 SPP1P10451 314 aa13.04□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 GNG2P59768 71 aa13.04□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 Q6ZR54 194 aa13.04□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 OR51H1Q8NH63 302 aa13.04□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 SCRT1Q9BWW7 348 aa13.04□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa13.03□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 PPYP01298 95 aa13.03□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 IFNA10P01566 189 aa13.03□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 C4BPBP20851 252 aa13.03□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 MFAP4P55083 255 aa13.03□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 ERVK-16P61578 105 aa13.03□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 RPL11P62913 178 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 SOHLH1Q5JUK2 328 aa13.03□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 LILRB2Q8N423 598 aa13.03□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 SLC25A46Q96AG3 418 aa13.03□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 GINS3Q9BRX5 216 aa13.03□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 CCDC90BQ9GZT6 254 aa13.03□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 SLC5A7Q9GZV3 580 aa13.03□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 VSIRQ9H7M9 311 aa13.03□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 COMMD9Q9P000 198 aa13.03□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 TBC1D24Q9ULP9 559 aa13.03□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 OR51B2Q9Y5P1 312 aa13.03□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 LRP1BQ9NZR2 4599 aa13.03□□□□□ -0.32
UBE2C-208ENST00000617055 APOHP02749 345 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 PTHLHP12272 177 aa13.02□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 RAB3BP20337 219 aa13.02□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 MYL9P24844 172 aa13.02□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 ARPC4P59998 168 aa13.02□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 AADACL3Q5VUY0 350 aa13.02□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 DUSP18Q8NEJ0 188 aa13.02□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 OR1P1Q8NH06 330 aa13.02□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 MGLLQ99685 303 aa13.02□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 TXN2Q99757 166 aa13.02□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 CLEC5AQ9NY25 188 aa13.02□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 RABAC1Q9UI14 185 aa13.02□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa13.01□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 MARCH11A6NNE9 402 aa13.01□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 I3L2K1 104 aa13.01□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 CDK2AP2O75956 126 aa13.01□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 CD74P04233 296 aa13.01□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa13.01□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa13.01□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa13.01□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 MISP3Q96FF7 219 aa13.01□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 TMEM14BQ9NUH8 114 aa13.01□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 NSG2Q9Y328 171 aa13.01□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 IFNA21P01568 189 aa13□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 IFNA17P01571 189 aa13□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 FXYD4P59646 89 aa13□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 TOMM20LQ6UXN7 152 aa13□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 Q6ZRM9 215 aa13□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa13□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 BEST4Q8NFU0 473 aa13□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 TMEM56Q96MV1 263 aa13□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 KNCNA6PVL3 124 aa12.99□□□□□ -0.33
UBE2C-208ENST00000617055 RGS10O43665 173 aa12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.1 ms