RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561518.5

RNPS1-204, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 5

Gene RNPS1, Length 1,092 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-204	ENST00000561518	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
RNPS1-204	ENST00000561518	GON7	Q9BXV9	100 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RNPS1-204	ENST00000561518	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
RNPS1-204	ENST00000561518	KLK15	Q9H2R5	256 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RNPS1-204	ENST00000561518	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RNPS1-204	ENST00000561518	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RNPS1-204	ENST00000561518	MED6	O75586	246 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RNPS1-204	ENST00000561518	IGLV1-40	P01703	118 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RNPS1-204	ENST00000561518	PF4V1	P10720	104 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RNPS1-204	ENST00000561518	MFAP2	P55001	183 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RNPS1-204	ENST00000561518	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
RNPS1-204	ENST00000561518	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
RNPS1-204	ENST00000561518	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RNPS1-204	ENST00000561518	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RNPS1-204	ENST00000561518	P2RX4	Q99571	388 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RNPS1-204	ENST00000561518	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RNPS1-204	ENST00000561518		A0A1B0GUS0	222 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	TMEM50A	O95807	157 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	IGHG4	P01861	327 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	CD28	P10747	220 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	DEFA4	P12838	97 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518		H3BP45	60 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	SNCA	P37840	140 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	PAX9	P55771	341 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	RIPPLY3	P57055	190 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	CD83	Q01151	205 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	TEX38	Q6PEX7	206 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518		H0YIZ8	118 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	TRGV3	P03979	118 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	PSMB8	P28062	276 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	FOXE3	Q13461	319 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	BSX	Q3C1V8	233 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	ZNF114	Q8NC26	417 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	OR4C12	Q96R67	309 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518		L7N2F9	121 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	OR2J3	O76001	311 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	IFNA10	P01566	189 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	ELANE	P08246	267 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	HTR2B	P41595	481 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	RAB9A	P51151	201 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	BCAP31	P51572	246 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	TPPP2	P59282	170 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	VAMP2	P63027	116 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518		Q5BKY6	102 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	OR1P1	Q8NH06	330 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	SMIM8	Q96KF7	97 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	RAB40C	Q96S21	281 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	C15orf62	A8K5M9	175 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	DEDD	O75618	318 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	NDUFB8	O95169	186 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	MPC2	O95563	127 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	NPY1R	P25929	384 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	RHOG	P84095	191 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	TMEM65	Q6PI78	240 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	COMMD1	Q8N668	190 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	MISP3	Q96FF7	219 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	MDFI	Q99750	246 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	RNF126	Q9BV68	326 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518		S4R3C0	116 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518		U3KQ87	197 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	SMLR1	H3BR10	107 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518		H3BUA1	57 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	RAP2B	P61225	183 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	C2orf83	Q53S99	150 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	RNF152	Q8N8N0	203 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	ZFP57	Q9NU63	452 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-204	ENST00000561518	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		13.59	□□□□□ -0.23

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