RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559551.5

RABGGTA-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, human

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 2,060 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTA-209	ENST00000559551	RAB40C	Q96S21	281 aa		11.43	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	TUBA4B	Q9H853	241 aa		11.43	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	WFDC1	Q9HC57	220 aa		11.43	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551		A0A0U1RQK1	487 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	OPN1MW	P04001	364 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	GATA3	P23771	443 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	LGALS7	P47929	136 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	11.42	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	ARL16	Q0P5N6	197 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	EBI3	Q14213	229 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	COMMD1	Q8N668	190 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	OR52E5	Q8NH55	327 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	OR4C12	Q96R67	309 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	GPR137B	O60478	399 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	SPCS3	P61009	180 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	DTD1	Q8TEA8	209 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	FBXL15	Q9H469	300 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	NIT2	Q9NQR4	276 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	FBXL17	Q9UF56	701 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	FCN1	O00602	326 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	IFNA17	P01571	189 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	VAMP2	P63027	116 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	CST7	O76096	145 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	MOS	P00540	346 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	GPR157	Q5UAW9	335 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	TEX45	Q8NA69	505 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	PIFO	Q8TCI5	191 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	CLCC1	Q96S66	551 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	PRND	Q9UKY0	176 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	JTB	O76095	146 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	NDUFA3	O95167	84 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	FSHB	P01225	129 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	PPT1	P50897	306 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	TAS2R30	P59541	319 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	PRSS8	Q16651	343 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	NPB	Q8NG41	125 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	OR4A5	Q8NH83	315 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	RNF5	Q99942	180 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RABGGTA-209	ENST00000559551	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.59
RABGGTA-209	ENST00000559551	C15orf62	A8K5M9	175 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RABGGTA-209	ENST00000559551		J3QLI3	93 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RABGGTA-209	ENST00000559551	RRH	O14718	337 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RABGGTA-209	ENST00000559551	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RABGGTA-209	ENST00000559551	PRCD	Q00LT1	54 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RABGGTA-209	ENST00000559551	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
RABGGTA-209	ENST00000559551	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
RABGGTA-209	ENST00000559551	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RABGGTA-209	ENST00000559551	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RABGGTA-209	ENST00000559551	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
RABGGTA-209	ENST00000559551	DYNLT3	P51808	116 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RABGGTA-209	ENST00000559551	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
RABGGTA-209	ENST00000559551	HES1	Q14469	280 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RABGGTA-209	ENST00000559551	MMD	Q15546	238 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RABGGTA-209	ENST00000559551	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
RABGGTA-209	ENST00000559551	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RABGGTA-209	ENST00000559551	NBR2	O15453	112 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGGTA-209	ENST00000559551	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGGTA-209	ENST00000559551		Q6ZRG5	221 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGGTA-209	ENST00000559551	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGGTA-209	ENST00000559551	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGGTA-209	ENST00000559551	HINT2	Q9BX68	163 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGGTA-209	ENST00000559551	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGGTA-209	ENST00000559551	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGGTA-209	ENST00000559551	SULT1A1	P50225	295 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGGTA-209	ENST00000559551	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGGTA-209	ENST00000559551	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGGTA-209	ENST00000559551	OR5B3	Q8NH48	314 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGGTA-209	ENST00000559551	TSPAN15	O95858	294 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGGTA-209	ENST00000559551	RAB5A	P20339	215 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGGTA-209	ENST00000559551	WT1-AS	Q06250	92 aa		11.37	□□□□□ -0.59

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