RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	OR4A16	Q8NH70	328 aa		15.81	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996		V9GYH0	126 aa		15.81	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	DISC1	C4P0D8	188 aa		15.8	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996		F8W735	103 aa	Predicted RBP	15.8	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996		K7EIM0	57 aa		15.8	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	LGALS9	O00182	355 aa		15.8	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	UCP1	P25874	307 aa		15.8	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		15.8	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		15.8	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		15.8	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		15.8	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	TMEM213	A2RRL7	107 aa		15.79	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	FOLR2	P14207	255 aa		15.79	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	15.79	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	PRCD	Q00LT1	54 aa		15.79	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	15.79	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	SPINK9	Q5DT21	86 aa		15.79	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	OR2C3	Q8N628	320 aa		15.79	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		15.79	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	TMEM56	Q96MV1	263 aa		15.79	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		15.79	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	THYN1	Q9P016	225 aa		15.79	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	GPR132	Q9UNW8	380 aa		15.79	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		15.79	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		15.78	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	OR5AC1	P0C628	307 aa		15.78	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		15.78	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	AKR1C2	P52895	323 aa		15.78	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	15.78	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	TRIM16L	Q309B1	348 aa		15.78	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		15.78	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996		Q8N402	240 aa		15.78	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	OR1P1	Q8NH06	330 aa		15.78	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	TRIM63	Q969Q1	353 aa		15.78	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		15.78	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		15.78	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996		A8MWP6	167 aa		15.77	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	15.77	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		15.77	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	ZNF79	Q15937	498 aa		15.77	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		15.77	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	LCN12	Q6JVE5	192 aa		15.77	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996		Q6ZRM9	215 aa		15.77	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		15.77	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		15.77	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		15.77	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	PRRT1	Q99946	306 aa		15.77	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	NAA60	Q9H7X0	242 aa		15.77	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	15.77	■□□□□ 0.12
CS-222	ENST00000550996	ZNF320	A2RRD8	509 aa		15.76	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	OR2T8	A6NH00	312 aa		15.76	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	15.76	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	CYB5B	O43169	146 aa		15.76	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	ST8SIA3	O43173	380 aa		15.76	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	TGOLN2	O43493	480 aa		15.76	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	15.76	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		15.76	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	TM4SF20	Q53R12	229 aa		15.76	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	ZNF114	Q8NC26	417 aa		15.76	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	TMEM230	Q96A57	120 aa		15.76	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		15.76	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		15.76	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		15.75	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	ZNF785	A8K8V0	405 aa		15.75	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996		I3L2K1	104 aa		15.75	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	CDS2	O95674	445 aa		15.75	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	CBLN1	P23435	193 aa		15.75	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	ADM	P35318	185 aa		15.75	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	PLET1	Q6UQ28	207 aa		15.75	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	CCDC190	Q86UF4	302 aa		15.75	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		15.75	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		15.75	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	15.75	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		15.75	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	MLX	Q9UH92	298 aa		15.75	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	15.75	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	15.74	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	B3GALNT1	O75752	331 aa		15.74	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	PYDC2	Q56P42	97 aa		15.74	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	15.74	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		15.74	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	MISP3	Q96FF7	219 aa		15.74	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	15.74	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		15.74	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	MCUB	Q9NWR8	336 aa		15.74	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	PRR13	Q9NZ81	148 aa		15.74	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996		U3KQK5	164 aa		15.74	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		15.73	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		15.73	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	15.73	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		15.73	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996		A8MZ25	164 aa		15.72	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		15.72	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	ATG12	O94817	140 aa		15.72	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	IGHV3-48	P01763	117 aa		15.72	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	C8orf88	P0DMB2	117 aa		15.72	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	ETV6	P41212	452 aa		15.72	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	AARD	Q4LEZ3	155 aa		15.72	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	15.72	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	15.72	■□□□□ 0.11

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