RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLDN16Q9Y5I7 305 aa13.86□□□□□ -0.19
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP13.85□□□□□ -0.195e-7■■■■■ 59.6
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ELOVL5Q9NYP7 299 aa13.85□□□□□ -0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AUP1Q9Y679 476 aa13.85□□□□□ -0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GBF1Q92538 1859 aa13.85□□□□□ -0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C19orf67A6NJJ6 358 aa13.85□□□□□ -0.19
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGKV1-33P01594 117 aa13.85□□□□□ -0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RELQ04864 619 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MORN2Q502X0 79 aa13.85□□□□□ -0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C19orf24Q9BVV8 132 aa13.85□□□□□ -0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa13.85□□□□□ -0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COMPP49747 757 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCNS1Q96KK3 526 aa13.85□□□□□ -0.19
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