RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299240.10

TTC17-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 17, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC17, Length 3,648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17-202ENST00000299240 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
TTC17-202ENST00000299240 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa10.16□□□□□ -0.78
TTC17-202ENST00000299240 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
TTC17-202ENST00000299240 KIAA1456Q9P272 454 aa10.16□□□□□ -0.78
TTC17-202ENST00000299240 FGF2P09038 288 aa10.15□□□□□ -0.78
TTC17-202ENST00000299240 LYL1P12980 280 aa10.15□□□□□ -0.78
TTC17-202ENST00000299240 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
TTC17-202ENST00000299240 RND2P52198 227 aa10.15□□□□□ -0.78
TTC17-202ENST00000299240 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
TTC17-202ENST00000299240 OR1L8Q8NGR8 309 aa10.15□□□□□ -0.78
TTC17-202ENST00000299240 DDB2Q92466 427 aa10.15□□□□□ -0.78
TTC17-202ENST00000299240 CORO2AQ92828 525 aa10.15□□□□□ -0.78
TTC17-202ENST00000299240 TMEM147Q9BVK8 224 aa10.15□□□□□ -0.78
TTC17-202ENST00000299240 PARP11Q9NR21 331 aa10.15□□□□□ -0.78
TTC17-202ENST00000299240 HIF1ANQ9NWT6 349 aa10.15□□□□□ -0.78
TTC17-202ENST00000299240 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa10.15□□□□□ -0.78
TTC17-202ENST00000299240 OR7C2O60412 319 aa10.15□□□□□ -0.78
TTC17-202ENST00000299240 WT1-ASQ06250 92 aa10.15□□□□□ -0.78
TTC17-202ENST00000299240 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
TTC17-202ENST00000299240 LCNL1Q6ZST4 164 aa10.15□□□□□ -0.78
TTC17-202ENST00000299240 OR5B12Q96R08 314 aa10.15□□□□□ -0.78
TTC17-202ENST00000299240 KAAG1Q9UBP8 84 aa10.15□□□□□ -0.78
TTC17-202ENST00000299240 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa10.15□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 SSTP61278 116 aa10.15□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 FAM78BQ5VT40 261 aa10.15□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 Q71RC1 249 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 PHYHIPLQ96FC7 376 aa10.15□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 PIMREGQ9BSJ6 248 aa10.15□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 DTX2Q86UW9 622 aa10.14□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 TMEM170AQ8WVE7 144 aa10.14□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 PRNDQ9UKY0 176 aa10.14□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 FAM74A7A6NL05 159 aa10.14□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa10.14□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 B2MP61769 119 aa10.14□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 ZNF90Q03938 601 aa10.14□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 FAM74A3Q4VXF1 159 aa10.14□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 NPCDR1Q9BY65 106 aa10.14□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 A0A1W2PPI3 338 aa10.14□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 SEC11BP0C7V7 166 aa10.14□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 TMEM11P17152 192 aa10.14□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 DLX6P56179 175 aa10.14□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 OR4F5Q8NH21 305 aa10.14□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 RAB24Q969Q5 203 aa10.14□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 OR4F4Q96R69 305 aa10.14□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 GINS3Q9BRX5 216 aa10.14□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 TMEM218A2RU14 115 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 UMAD1C9J7I0 102 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 IGHV2-5P01817 119 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 NPBWR1P48145 328 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 FXYD3Q14802 87 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 PPP1R27Q86WC6 154 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 PXMP4Q9Y6I8 212 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 NECAP1Q8NC96 275 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 OR51G1Q8NGK1 321 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 BLNKQ8WV28 456 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 GNB4Q9HAV0 340 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 PAGE4O60829 102 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 KIR2DS2P43631 304 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 PSG5Q15238 335 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 SOHLH1Q5JUK2 328 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 TREML4Q6UXN2 200 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 OR5AN1Q8NGI8 311 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 SLC25A33Q9BSK2 321 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP10.12□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 TRAV5A0A0B4J249 113 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 ADCYAP1P18509 176 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 LMO4P61968 165 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 CR1LQ2VPA4 569 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 FOXH1O75593 365 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 RPP30P78346 268 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 OR1B1Q8NGR6 318 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 SUN5Q8TC36 379 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 COA4Q9NYJ1 87 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 ZNF727A8MUV8 499 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 SLC35E1Q96K37 410 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 ATRQ13535 2644 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 PGPEP1LA6NFU8 196 aa10.11□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 LINC01548A6NM66 108 aa10.11□□□□□ -0.79
TTC17-202ENST00000299240 VENTXO95231 258 aa10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms