RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 SIGMAR1Q99720 223 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRM-211ENST00000580170 MEIG1Q5JSS6 88 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRM-211ENST00000580170 UCP1P25874 307 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRM-211ENST00000580170 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRM-211ENST00000580170 ELOVL5Q9NYP7 299 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRM-211ENST00000580170 MOB4Q9Y3A3 225 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRM-211ENST00000580170 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
PTPRM-211ENST00000580170 CLDND2Q8NHS1 167 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRM-211ENST00000580170 C18orf15Q96N68 181 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRM-211ENST00000580170 FAM19A2Q8N3H0 131 aa18.02■□□□□ 0.48
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PTPRM-211ENST00000580170 OR13A1Q8NGR1 328 aa18.02■□□□□ 0.48
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PTPRM-211ENST00000580170 PARP14Q460N5 1801 aa18.02■□□□□ 0.47
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PTPRM-211ENST00000580170 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
PTPRM-211ENST00000580170 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
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PTPRM-211ENST00000580170 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa18.01■□□□□ 0.47
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PTPRM-211ENST00000580170 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa18■□□□□ 0.47
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PTPRM-211ENST00000580170 A0A1W2PRS3 328 aa18■□□□□ 0.47
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PTPRM-211ENST00000580170 PEX7O00628 323 aa18■□□□□ 0.47
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PTPRM-211ENST00000580170 TEX29Q8N6K0 151 aa18■□□□□ 0.47
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
PTPRM-211ENST00000580170 FDCSPQ8NFU4 85 aa18■□□□□ 0.47
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PTPRM-211ENST00000580170 A6NNC1 897 aa18■□□□□ 0.47
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
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PTPRM-211ENST00000580170 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
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PTPRM-211ENST00000580170 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF236Q9UL36 1845 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRM-211ENST00000580170 APOMO95445 188 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRM-211ENST00000580170 ATP5J2P56134 94 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRM-211ENST00000580170 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
PTPRM-211ENST00000580170 FAM27E3Q08E93 113 aa17.97■□□□□ 0.47
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