RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533873.1

ACER3-213, Transcript of alkaline ceramidase 3, human

TSL 2 BASIC

Gene ACER3, Length 929 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACER3-213	ENST00000533873	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	MFNG	O00587	321 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	TMEM127	O75204	238 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	MED6	O75586	246 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	OR2A4	O95047	310 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	ELANE	P08246	267 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	GNB3	P16520	340 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	DTYMK	P23919	212 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	NPBWR1	P48145	328 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	FOXE3	Q13461	319 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	PDPN	Q86YL7	162 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	DTD1	Q8TEA8	209 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	OR2A7	Q96R45	310 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	PARP11	Q9NR21	331 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF580	Q9UK33	172 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	ETV7	Q9Y603	341 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873		A0A0A6YYH2	397 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873		A6NJ64	397 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	COLCA2	A8K830	154 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873		H0YJW9	148 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873		M0R1X1	148 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	RAB27B	O00194	218 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	BCL2L11	O43521	198 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	HLA-DRB1	P01911	266 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	IGF1	P05019	195 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	SCT	P09683	121 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	CTXN2	P0C2S0	81 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	OR8U8	P0C7N1	319 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	G0S2	P27469	103 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	TMEM50B	P56557	158 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	RTL8B	Q17RB0	113 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF695	Q8IW36	515 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	OR8U1	Q8NH10	309 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	RAB24	Q969Q5	203 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	RNF5	Q99942	180 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	OR2D2	Q9H210	308 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	5.42	□□□□□ -1.54	1e-7	■■■■■ 26.9
ACER3-213	ENST00000533873	RNF150	Q9ULK6	438 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	CXorf65	A6NEN9	183 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873		G3V4G9	280 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	GOSR2	O14653	212 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	RRH	O14718	337 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	CTDSPL	O15194	276 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	ATP6V0E1	O15342	81 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	NDUFA3	O95167	84 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	IGHG4	P01861	327 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	LINC00614	P0C842	121 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	MYCNOS	P40205	109 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	F2RL1	P55085	397 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	DGCR2	P98153	550 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	AARD	Q4LEZ3	155 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873		Q6ZPA2	131 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873		Q6ZS49	121 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		5.41	□□□□□ -1.54

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.8 ms