RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521038.5

PHF20L1-217, Transcript of PHD finger protein 20 like 1, human

TSL 5

Gene PHF20L1, Length 427 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHF20L1-217	ENST00000521038	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	DUSP13	Q9UII6	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	INSL6	Q9Y581	213 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	LINC01619	G3V211	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038		H3BMG7	143 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038		M0QXV9	152 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	SYNGR1	O43759	233 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZIC3	O60481	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	SAP30	O75446	220 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	CXCL10	P02778	98 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	STATH	P02808	62 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	CLPS	P04118	112 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	FAM87A	P0C7U9	286 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	IAPP	P10997	89 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	CCL2	P13500	99 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	CRYGS	P22914	178 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	CD38	P28907	300 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	FASLG	P48023	281 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	ATP5G3	P48201	142 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	ARL16	Q0P5N6	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	KIR3DS1	Q14943	382 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	TNXA	Q16473	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	CENPW	Q5EE01	88 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	LILRA6	Q6PI73	481 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038		Q6Q795	121 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZNF611	Q8N823	705 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	OR10D3	Q8NH80	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	RNF138	Q8WVD3	245 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	NAT6	Q93015	286 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	SARAF	Q96BY9	339 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	GALM	Q96C23	342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	LYZL4	Q96KX0	146 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	CACNA1C	Q13936	2221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	C21orf140	B9A014	251 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038		H3BUT2	72 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	IGKV1-5	P01602	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	JMJD7	P0C870	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038		P0C879	139 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	ASIP	P42127	132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	PMP22	Q01453	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	TLE1	Q04724	770 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	SRY	Q05066	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	PRR22	Q8IZ63	422 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	RPRML	Q8N4K4	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	TEX45	Q8NA69	505 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	OR10G6	Q8NH81	332 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	RCHY1	Q96PM5	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZNF492	Q9P255	531 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHF20L1-217	ENST00000521038	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 162.6 ms