RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 PARLQ9H300 379 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 H0YJW9 148 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 CA2P00918 260 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 MEOX2P50222 304 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 RPS16P62249 146 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 RAB31Q13636 194 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 ANAPC16Q96DE5 110 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 PLEKHA3Q9HB20 300 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 A0A1W2PPV4 95 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 J3QR06 171 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 RPL35P42766 123 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 RPL23P62829 140 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 PRR20EP86478 221 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 PRR20CP86479 221 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 PRR20DP86480 221 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 PRR20BP86481 221 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 PRR20AP86496 221 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 SSX2Q16385 188 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM204Q9BSN7 226 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 DOK5Q9P104 306 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 CD99P14209 185 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM155Q4W5P6 130 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 OR4F5Q8NH21 305 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 NANPQ8TBE9 248 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 TNFRSF14Q92956 283 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 OR4F4Q96R69 305 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 PAGE4O60829 102 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 LOXP28300 417 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 RPS10P46783 165 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF343Q6P1L6 599 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 VSTM2AQ8TAG5 236 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 SLC35E1Q96K37 410 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 SSX3Q99909 188 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 C11orf94C9JXX5 98 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 IGKV1-16P04430 117 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 CA7P43166 264 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 AKR1D1P51857 326 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 S100A12P80511 92 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM144Q7Z5S9 345 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 C19orf24Q9BVV8 132 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 CD3EP07766 207 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 USF1P22415 310 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 FABP9Q0Z7S8 132 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 FAM210BQ96KR6 192 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 C12orf57Q99622 126 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 CTSZQ9UBR2 303 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 PFN1P07737 140 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 B2MP61769 119 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 RHOBP62745 196 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 HNF4GQ14541 408 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 SPNS3Q6ZMD2 512 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 GATAD1Q8WUU5 269 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 NABP2Q9BQ15 211 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 DYNLRB1Q9NP97 96 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 CACNA1DQ01668 2161 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 CFAP46Q8IYW2 2715 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 PHOX2AO14813 284 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 RBP4P02753 201 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 HOXA5P20719 270 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 CASP6P55212 293 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 MIC13Q5XKP0 118 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 OR4C13Q8NGP0 309 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 CACNG8Q8WXS5 425 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 A0A1W2PN81 502 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 DVL1O14640 695 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 CCL3L1P16619 93 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 CHRNA7P36544 502 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 GCSAMLQ5JQS6 135 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 LYPD2Q6UXB3 125 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 STPG3Q8N7X2 389 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 OR9G1Q8NH87 305 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 IMMP2LQ96T52 175 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 SLC45A2Q9UMX9 530 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 CLN5O75503 358 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 AREGP15514 252 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 MC5RP33032 325 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF674Q2M3X9 581 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 CCL17Q92583 94 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 ATRXP46100 2492 aa9.92□□□□□ -0.82
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