RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000631057.2

GPC3-204, Transcript of glypican 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GPC3, Length 1,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3-204ENST00000631057 POU2AF1Q16633 256 aa6.65□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 KRTCAP3Q53RY4 240 aa6.65□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 SPRNQ5BIV9 151 aa6.65□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.65□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 STUMQ69YW2 141 aa6.65□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.65□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa6.65□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.65□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 C1orf159Q96HA4 380 aa6.65□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 BTF3L4Q96K17 158 aa6.65□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 MS4A5Q9H3V2 200 aa6.65□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 GCM1Q9NP62 436 aa6.65□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.65□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.65□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 DMRT1Q9Y5R6 373 aa6.65□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.65□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 CEP250Q9BV73 2442 aa6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 TRAV3A0A0B4J244 114 aa6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 FNDC10F2Z333 226 aa6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 TMPRSS2O15393 492 aa6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 IGHV1-46P01743 117 aa6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 IGHV3-7P01780 117 aa6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 SOD3P08294 240 aa6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 SELLP14151 372 aa6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 IRF2P14316 349 aa6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 NPY1RP25929 384 aa6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 RTP5Q14D33 572 aa6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 TMEM177Q53S58 311 aa6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 PYY3Q5JQD4 70 aa6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 CST9LP1Q5W188 147 aa6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 OR4A47Q6IF82 309 aa6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 ZNF439Q8NDP4 499 aa6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 SLC24A4Q8NFF2 622 aa6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 OR2T10Q8NGZ9 312 aa6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 OR4X1Q8NH49 305 aa6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 FAM57AQ8TBR7 257 aa6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 CORO2AQ92828 525 aa6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 FAM122AQ96E09 287 aa6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 GAFA1Q96PS6 74 aa6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 PFDN5Q99471 154 aa6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 MGST2Q99735 147 aa6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 GPR61Q9BZJ8 451 aa6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 LINC00574Q9H8X3 128 aa6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 NPVFQ9HCQ7 196 aa6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 PRNDQ9UKY0 176 aa6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 NKX6-3A6NJ46 265 aa6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 MT-CO2P00403 227 aa6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 IGHV2-70P01814 119 aa6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 TYMSP04818 313 aa6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 STAG3L2P0CL84 134 aa6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 STAG3L3P0CL85 134 aa6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 DEFA4P12838 97 aa6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 CD40P25942 277 aa6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 PLA2G5P39877 138 aa6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 ATP5G3P48201 142 aa6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 UBE2G2P60604 165 aa6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 RHOBP62745 196 aa6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 GNB1P62873 340 aa6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 RTL8BQ17RB0 113 aa6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 FAM201AQ5SY85 155 aa6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 MIC13Q5XKP0 118 aa6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 LYG1Q8N1E2 194 aa6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 ABHD12Q8N2K0 398 aa6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 RPRMLQ8N4K4 120 aa6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 ZNF383Q8NA42 475 aa6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 NECAP1Q8NC96 275 aa6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 NUP37Q8NFH4 326 aa6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 LEAP2Q969E1 77 aa6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 IMMP2LQ96T52 175 aa6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 TMEM204Q9BSN7 226 aa6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 CHODLQ9H9P2 273 aa6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 A0A1W2PPQ1 181 aa6.62□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 hADV38S2A0JD32 116 aa6.62□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 FABP4P15090 132 aa6.62□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 CD33P20138 364 aa6.62□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 NPPCP23582 126 aa6.62□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 GCHFRP30047 84 aa6.62□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 LCN2P80188 198 aa6.62□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
GPC3-204ENST00000631057 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.6 ms