RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518290.1

ARFGEF1-204, Transcript of ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ARFGEF1, Length 3,179 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1-204ENST00000518290 RTL8BQ17RB0 113 aa6.52□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 KLK9Q2XQG4 91 aa6.52□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 KHDC3LQ587J8 217 aa6.52□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.52□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 TMEM133Q9H2Q1 129 aa6.52□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 DYNLRB1Q9NP97 96 aa6.52□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.52□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.52□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 ODF3BA8MYP8 253 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 OVOL3O00110 214 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 AP4M1O00189 453 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 TSPAN15O95858 294 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 IAPPP10997 89 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 PAX1P15863 534 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 OPRK1P41145 380 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 ISOC2Q96AB3 205 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 YPEL4Q96NS1 127 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 HRH4Q9H3N8 390 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 TCF19Q9Y242 345 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 ZGRF1Q86YA3 2104 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 A0A1W2PPH5 198 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 A0A1W2PR64 198 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 A0A1W2PRV1 198 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 YIF1AO95070 293 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 MC5RP33032 325 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 ICAM4Q14773 271 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 LINC01560Q8TB33 94 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 LINC00205P59089 165 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 OR2B8PP59922 312 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 OR10P1Q8NGE3 313 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 RAB1BQ9H0U4 201 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 CHODLQ9H9P2 273 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa6.51□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 A0A087WWC5 75 aa6.5□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 MT-ND4LP03901 98 aa6.5□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 USF1P22415 310 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 DDTP30046 118 aa6.5□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 FHITP49789 147 aa6.5□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 RHEBQ15382 184 aa6.5□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.5□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 OR13D1Q8NGV5 346 aa6.5□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 OR4A16Q8NH70 328 aa6.5□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 CACNA1AO00555 2505 aa6.5□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 RBFOX3A6NFN3 312 aa6.5□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 CGB1A6NKQ9 187 aa6.5□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 COL8A2P25067 703 aa6.5□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 RUNX1Q01196 453 aa6.5□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 HLA-DRB5Q30154 266 aa6.5□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 TEX45Q8NA69 505 aa6.5□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 OR4C13Q8NGP0 309 aa6.5□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 VSTM2AQ8TAG5 236 aa6.5□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.5□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 RPRMQ9NS64 109 aa6.5□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa6.49□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 TRAV3A0A0B4J244 114 aa6.49□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 DLL1O00548 723 aa6.49□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 LGALS7P47929 136 aa6.49□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 SPANXN5Q5MJ07 72 aa6.49□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 SSX7Q7RTT5 188 aa6.49□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 LYG1Q8N1E2 194 aa6.49□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.49□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.49□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.49□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 APC2O95996 2303 aa6.49□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa6.49□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.49□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 C17orf112F2Z3M2 114 aa6.49□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 C1QL1O75973 258 aa6.49□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 IGKV1D-33P01593 117 aa6.49□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 IGKV1-33P01594 117 aa6.49□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 CCL3L1P16619 93 aa6.49□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 RAB5AP20339 215 aa6.49□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 IL3RAP26951 378 aa6.49□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 PRR20EP86478 221 aa6.49□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 PRR20CP86479 221 aa6.49□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 PRR20DP86480 221 aa6.49□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 PRR20BP86481 221 aa6.49□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 PRR20AP86496 221 aa6.49□□□□□ -1.37
ARFGEF1-204ENST00000518290 GAMTQ14353 236 aa6.49□□□□□ -1.37
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