RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476464.5

PSMD6-206, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 6, human

TSL 2

Gene PSMD6, Length 2,052 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD6-206	ENST00000476464	GGACT	Q9BVM4	153 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	TUBA4B	Q9H853	241 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	TREML4	Q6UXN2	200 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	ZFP82	Q8N141	532 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	LRBA	P50851	2863 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	PRSS46	E5RG02	174 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464		J3QR06	171 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	UPK2	O00526	184 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	CYB5B	O43169	146 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	NDUFA2	O43678	99 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	MPDU1	O75352	247 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	OR2C1	O95371	312 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	CA2	P00918	260 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	MT-ND4L	P03901	98 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	CTRB1	P17538	263 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464		Q8N7P7	452 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	HARBI1	Q96MB7	349 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	PSMB3	P49720	205 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	P2RX4	Q99571	388 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	ZNF727	A8MUV8	499 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464		H0YJW9	148 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	MGST2	Q99735	147 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464		A0A1W2PR64	198 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464		A0A1W2PRV1	198 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	KBTBD11	O94819	623 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	RAB13	P51153	203 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PSMD6-206	ENST00000476464	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	COL8A2	P25067	703 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	OPRK1	P41145	380 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	DLX6	P56179	175 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	PRCD	Q00LT1	54 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	PMS2P11	Q13670	270 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464		A0A1W2PPV4	95 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	FOLR2	P14207	255 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	CD81	P60033	236 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	BET1L	Q9NYM9	111 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	TSPAN9	O75954	239 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	C1QTNF9	P0C862	333 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	RAB5A	P20339	215 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	MIC13	Q5XKP0	118 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	OR9G1	Q8NH87	305 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	TMEM186	Q96B77	213 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464		A0A087WWC5	75 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	YIF1A	O95070	293 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	RAB5B	P61020	215 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	LINC00311	Q8N616	119 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	RNF212	Q495C1	297 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	TEPP	Q6URK8	271 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	OR4F5	Q8NH21	305 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	OR5B3	Q8NH48	314 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	OR4F4	Q96R69	305 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	NABP2	Q9BQ15	211 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	SOX15	O60248	233 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	PAGE4	O60829	102 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PSMD6-206	ENST00000476464	LY6D	Q14210	128 aa		13.49	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms