RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472863.5

HOXB3-207, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-207ENST00000472863 FBXL17Q9UF56 701 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 TCF19Q9Y242 345 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 CCDC168Q8NDH2 2452 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 GATA3P23771 443 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 VMA21Q3ZAQ7 101 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 SLC51BQ86UW2 128 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 VSTM2AQ8TAG5 236 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 SPDEFO95238 335 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 TAS2R30P59541 319 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 PJVKQ0ZLH3 352 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 PSG5Q15238 335 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 SLC25A31Q9H0C2 315 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 RGS13O14921 159 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 F2RL1P55085 397 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 RPL8P62917 257 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF680Q8NEM1 530 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 OR4A5Q8NH83 315 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 WFDC1Q9HC57 220 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 PLXNB1O43157 2135 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 CRYGBP07316 175 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 HES1Q14469 280 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 TMEM217Q8N7C4 229 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 TEX45Q8NA69 505 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 RNF5Q99942 180 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 HINT2Q9BX68 163 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 MOSP00540 346 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 METTL15P1P0C7V9 234 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 OR4C12Q96R67 309 aa22.02■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 SIGLEC9Q9Y336 463 aa22.02■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 E7EUB6 86 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 FAM120AOSQ5T036 256 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 ST8SIA2Q92186 375 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 FBXL15Q9H469 300 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 FKBP11Q9NYL4 201 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 CACFD1Q9UGQ2 172 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 TAAR5O14804 337 aa22■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 CLCC1Q96S66 551 aa22■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 COMMD5Q9GZQ3 224 aa22■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 FGF2P09038 288 aa22■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 SULT1A1P50225 295 aa22■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 DYNLT3P51808 116 aa22■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 ARL16Q0P5N6 197 aa22■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 MMDQ15546 238 aa22■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 C10orf55Q5SWW7 151 aa22■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa22■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 OR5C1Q8NGR4 320 aa22■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 OR2T10Q8NGZ9 312 aa22■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 CLINT1Q14677 625 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 HAPLN4Q86UW8 402 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 STX12Q86Y82 276 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 OR5B3Q8NH48 314 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 HIPK2Q9H2X6 1198 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 ITPR3Q14573 2671 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 CREBBPQ92793 2442 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 ABCA1O95477 2261 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 A0A0U1RQK1 487 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 PRCDQ00LT1 54 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 BAXQ07812 192 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 PRSS8Q16651 343 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 THNSL2Q86YJ6 484 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 FOXC2Q99958 501 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 UBA52P62987 128 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 EBI3Q14213 229 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 ALKAL2Q6UX46 152 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 PPP1R27Q86WC6 154 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 OR10W1Q8NGF6 305 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 CSPG4Q6UVK1 2322 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 ZFHX3Q15911 3703 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 FCN1O00602 326 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 RRHO14718 337 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 OR1L8Q8NGR8 309 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 CGB1A6NKQ9 187 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 J3QLI3 93 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 NBR2O15453 112 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXB3-207ENST00000472863 Q8N6K4 173 aa21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms