RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436638.5

ECHDC1-208, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ECHDC1, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-208	ENST00000436638	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638		Q6P435	159 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	UQCC3	Q6UW78	93 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638		Q6ZTK2	550 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	TEX29	Q8N6K0	151 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	PTX4	Q96A99	478 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	ISOC2	Q96AB3	205 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	TM2D1	Q9BX74	207 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	ARL6	Q9H0F7	186 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	DUX4	Q9UBX2	424 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	TENM4	Q6N022	2769 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	FLNC	Q14315	2725 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A087X0K7	114 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	UBE2QL1	A1L167	161 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638		A8MWP6	167 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638		H3BMQ9	156 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638		J3QLI3	93 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	CD5L	O43866	347 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	ORC5	O43913	435 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF737	O75373	536 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	IFNA1	P01562	189 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	CSN2	P05814	226 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	EDN2	P20800	178 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	ETV6	P41212	452 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	DEFA1	P59665	94 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	DEFA3	P59666	94 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	QRFP	P83859	136 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	UNC119	Q13432	240 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	ARFRP1	Q13795	201 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	MRAP2	Q96G30	205 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	JPT1	Q9UK76	154 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	COL12A1	Q99715	3063 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	ODAM	A1E959	279 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	USP17L23	D6RBM5	183 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	SOCS1	O15524	211 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	ATG12	O94817	140 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	VENTX	O95231	258 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	LY6G6D	O95868	133 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	C8orf88	P0DMB2	117 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	VPREB1	P12018	145 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	TBP	P20226	339 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	CHAT	P28329	748 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	MNDA	P41218	407 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	GLP1R	P43220	463 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	GLIPR1	P48060	266 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	EFNB2	P52799	333 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	PIGP	P57054	158 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	RAB25	P57735	213 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	TCTA	P57738	103 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		5.04	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms