RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 H3BMH7 237 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 TNFSF13O75888 250 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 KBTBD11O94819 623 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 VENTXO95231 258 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 MPZL1O95297 269 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 AHSA1O95433 338 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 SEMA4FO95754 770 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 PRH1P02810 166 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 ZNF728P0DKX0 622 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 KLK2P20151 261 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 SERPINA2P20848 420 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 FUT3P21217 361 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 OR10J1P30954 320 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 APLNRP35414 380 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 MDH2P40926 338 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 PIGPP57054 158 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 FBXW4P57775 412 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 RPS20P60866 119 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 RANP62826 216 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 GRB2P62993 217 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 HERV-K104P63124 156 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 PAX5Q02548 391 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 GPM6BQ13491 265 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 ARFRP1Q13795 201 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 GNMTQ14749 295 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 HERPUD1Q15011 391 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 KISS1Q15726 138 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 CHRFAM7AQ494W8 412 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 AKIRIN2Q53H80 203 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 MUC21Q5SSG8 566 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 TMEM42Q69YG0 159 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 LYZL2Q7Z4W2 148 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 GTSCR1Q86UQ5 136 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 WDFY1Q8IWB7 410 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 OR52M1Q8NGK5 317 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 OR1B1Q8NGR6 318 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 TSLPQ969D9 159 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 ATP5SQ99766 215 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 GABRG3Q99928 467 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 SMIM3Q9BZL3 60 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 TMEM222Q9H0R3 208 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 JPT2Q9H910 190 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 GNB4Q9HAV0 340 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 SLC2A9Q9NRM0 540 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 GLRX2Q9NS18 164 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 NECAP2Q9NVZ3 263 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 NAT8Q9UHE5 227 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
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TRDN-204ENST00000542443 FAM24AA6NFZ4 105 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 C11orf98E9PRG8 122 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 K7EP13 123 aa3.94□□□□□ -1.78
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TRDN-204ENST00000542443 DHRS3O75911 302 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 SYNGR4O95473 234 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 TMEM50AO95807 157 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 HRASP01112 189 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 MBP02144 154 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 REG1AP05451 166 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 AREGP15514 252 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 TCN2P20062 427 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 GZMHP20718 246 aa3.94□□□□□ -1.78
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TRDN-204ENST00000542443 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
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TRDN-204ENST00000542443 ID1P41134 155 aa3.94□□□□□ -1.78
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TRDN-204ENST00000542443 ZNF726P1Q15940 193 aa3.94□□□□□ -1.78
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TRDN-204ENST00000542443 C10orf128Q5T292 105 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 DCAF12Q5T6F0 453 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 ZNF774Q6NX45 483 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 RABEPKQ7Z6M1 372 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 CMTM1Q8IZ96 169 aa3.94□□□□□ -1.78
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TRDN-204ENST00000542443 ZNRF1Q8ND25 227 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 OR51T1Q8NGJ9 327 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 OR51E1Q8TCB6 317 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 TMEM234Q8WY98 164 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 MIEN1Q9BRT3 115 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 BANF2Q9H503 90 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 CRLF2Q9HC73 371 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 FAM60AQ9NP50 221 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 ASCL3Q9NQ33 180 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 THADAQ6YHU6 1953 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 BRCA2P51587 3418 aa3.93□□□□□ -1.78
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