RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, human

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTDSPL-208	ENST00000486978	TAS2R20	P59543	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	MFSD4A	Q8N468	514 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	OR5T1	Q8NG75	326 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	SNAPC3	Q92966	411 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	PHB2	Q99623	299 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	IFT46	Q9NQC8	304 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	SCOC	Q9UIL1	159 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	MPPED1	O15442	326 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	SAP30	O75446	220 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	ACTL6B	O94805	426 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	OR9G9	P0C7N8	305 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	SMIM18	P0DKX4	95 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	NAT1	P18440	290 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	ECI1	P42126	302 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	FXYD4	P59646	89 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	HERV-K104	P61576	105 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	VBP1	P61758	197 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	NCS1	P62166	190 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	ZNF429	Q86V71	674 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	TMEM17	Q86X19	198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	MMD2	Q8IY49	270 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	USMG5	Q96IX5	58 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	CMTM3	Q96MX0	182 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	SPIN2A	Q99865	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	COA4	Q9NYJ1	87 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	EHF	Q9NZC4	300 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	SORL1	Q92673	2214 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	FAM223B	A6NKX1	122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	TNFSF12	O43508	249 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	JTB	O76095	146 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	KBTBD11	O94819	623 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	OR2A4	O95047	310 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	GABARAP	O95166	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	LY86	O95711	162 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	HRAS	P01112	189 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	APOA1	P02647	267 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	APELA	P0DMC3	54 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	ZP3	P21754	424 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	PRSS3	P35030	304 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	MAS1L	P35410	378 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	RFX2	P48378	723 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	RORC	P51449	518 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	TAS2R46	P59540	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	DEFA5	Q01523	94 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	CATR1	Q13166	79 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	BORCS5	Q969J3	196 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	OR2A7	Q96R45	310 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	GPHA2	Q96T91	129 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTDSPL-208	ENST00000486978	HMX3	A6NHT5	357 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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