RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF735P0CB33 412 aa14.02□□□□□ -0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STAG3L2P0CL84 134 aa14.02□□□□□ -0.16
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CORTO00230 105 aa14.02□□□□□ -0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DLL1O00548 723 aa14.02□□□□□ -0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.16
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa14.02□□□□□ -0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GRIFINA4D1Z8 144 aa14.02□□□□□ -0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C8orf88P0DMB2 117 aa14.02□□□□□ -0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PKIAP61925 76 aa14.02□□□□□ -0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa14.02□□□□□ -0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR4C13Q8NGP0 309 aa14.02□□□□□ -0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RNF115Q9Y4L5 304 aa14.02□□□□□ -0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MOSP00540 346 aa14.02□□□□□ -0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LHX2P50458 406 aa14.02□□□□□ -0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.17
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