RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460120.5

HPS3-202, Transcript of HPS3, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HPS3, Length 2,745 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3-202ENST00000460120 S100A2P29034 98 aa14.97□□□□□ -0.01
HPS3-202ENST00000460120 GLRXP35754 106 aa14.97□□□□□ -0.01
HPS3-202ENST00000460120 CHRNA7P36544 502 aa14.97□□□□□ -0.01
HPS3-202ENST00000460120 C17orf58Q2M2W7 97 aa14.97□□□□□ -0.01
HPS3-202ENST00000460120 C1orf185Q5T7R7 199 aa14.97□□□□□ -0.01
HPS3-202ENST00000460120 TRAT1Q6PIZ9 186 aa14.97□□□□□ -0.01
HPS3-202ENST00000460120 GGACTQ9BVM4 153 aa14.97□□□□□ -0.01
HPS3-202ENST00000460120 GCM1Q9NP62 436 aa14.97□□□□□ -0.01
HPS3-202ENST00000460120 PCNX1Q96RV3 2341 aa14.97□□□□□ -0.01
HPS3-202ENST00000460120 HCFC1P51610 2035 aa14.97□□□□□ -0.01
HPS3-202ENST00000460120 A0A1W2PPQ1 181 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS3-202ENST00000460120 YPEL1O60688 119 aa14.96□□□□□ -0.01
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HPS3-202ENST00000460120 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
HPS3-202ENST00000460120 YPEL2Q96QA6 119 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS3-202ENST00000460120 TCEAL7Q9BRU2 100 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS3-202ENST00000460120 GNB2P62879 340 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS3-202ENST00000460120 RELBQ01201 579 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS3-202ENST00000460120 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
HPS3-202ENST00000460120 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
HPS3-202ENST00000460120 WFDC8Q8IUA0 241 aa14.96□□□□□ -0.01
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HPS3-202ENST00000460120 TUBG2Q9NRH3 451 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS3-202ENST00000460120 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 IGHV1-46P01743 117 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 NPPCP23582 126 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 TREML4Q6UXN2 200 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 Q8N7P7 452 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 TMEM170AQ8WVE7 144 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 RHOVQ96L33 236 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 TCF19Q9Y242 345 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 H7BYZ3 331 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 PPP1R2P9O14990 202 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 CEACAM4O75871 244 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 FABP4P15090 132 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 NDUFB7P17568 137 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 S100PP25815 95 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 GALR1P47211 349 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 SPCS3P61009 180 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 SSTP61278 116 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 WDR83OSQ9Y284 106 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 BSNQ9UPA5 3926 aa14.95□□□□□ -0.02
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HPS3-202ENST00000460120 GATCO43716 136 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 PYY3Q5JQD4 70 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 OR13D1Q8NGV5 346 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 MGST2Q99735 147 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 PCGF1Q9BSM1 259 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 RNF7Q9UBF6 113 aa14.94□□□□□ -0.02
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HPS3-202ENST00000460120 NDUFB4O95168 129 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 ARL14EPLP0DKL9 152 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 VWC2Q2TAL6 325 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 OR4A47Q6IF82 309 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 PXMP4Q9Y6I8 212 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 PTPRBP23467 1997 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 ACACAQ13085 2346 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 LHBP01229 141 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 RND2P52198 227 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 SELENOVP59797 346 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 ZNF383Q8NA42 475 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 MANBALQ9NQG1 85 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 GFOD1Q9NXC2 390 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 F2RL2O00254 374 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
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HPS3-202ENST00000460120 TCF23Q7RTU1 214 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 MOB3BQ86TA1 216 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 OR4S2Q8NH73 311 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 OR5B12Q96R08 314 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 ACTL6BO94805 426 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 Q6ZS92 163 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 IGKV1-16P04430 117 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 CD40P25942 277 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 REG1BP48304 166 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 GNB1P62873 340 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 OR10A7Q8NGE5 316 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 GAFA1Q96PS6 74 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 A0A1B0GWJ7 208 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 PRSS8Q16651 343 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 OR4X1Q8NH49 305 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 GGTLC1Q9BX51 225 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 TMEM250H0YL14 139 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 CA2P00918 260 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS3-202ENST00000460120 RPP30P78346 268 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
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