RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 MOB1BQ7L9L4 216 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 LILRB2Q8N423 598 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 CBR4Q8N4T8 237 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 GBGT1Q8N5D6 347 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM217Q8N7C4 229 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 POM121L12Q8N7R1 296 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 TEX45Q8NA69 505 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 SETD9Q8NE22 299 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 RNF2Q99496 336 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 CABLES2Q9BTV7 478 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 PECRQ9BY49 303 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 MFFQ9GZY8 342 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 CSTL1Q9H114 145 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 C5orf66Q9H5L9 145 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 SCRT2Q9NQ03 307 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 BABAM2Q9NXR7 383 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 CLEC5AQ9NY25 188 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 KLK9Q9UKQ9 250 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 IGLC7A0M8Q6 106 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR2T8A6NH00 312 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 NPIPB5A8MRT5 1133 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 MPTX1A8MV57 137 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 C16orf90A8MZG2 172 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRDCB7Z8K6 153 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 FABP7O15540 132 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 FCGR3BO75015 233 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 CDK2AP2O75956 126 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 KBTBD11O94819 623 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 APOHP02749 345 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 AMBPP02760 352 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 CRYGCP07315 174 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 SRMP19623 302 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 RTL8BQ17RB0 113 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 LGALS9BQ3B8N2 356 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 ANKRD55Q3KP44 614 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 VMA21Q3ZAQ7 101 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM106AQ4KMX7 169 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 DNAL1Q4LDG9 190 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 YIF1BQ5BJH7 314 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM209BQ5JX69 171 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC197Q8NCU1 140 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR10W1Q8NGF6 305 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR4A5Q8NH83 315 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPIN2AQ99865 258 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 C20orf24Q9BUV8 137 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 C12orf4Q9NQ89 552 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC2A9Q9NRM0 540 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 CKLFQ9UBR5 152 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 LRRC42Q9Y546 428 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRAV10A0A0B4J240 114 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 TGOLN2O43493 480 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 CD74P04233 296 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 FCGR3AP08637 254 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 CELP19835 753 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 ELLP55199 621 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 TCTAP57738 103 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 KRTAP10-2P60368 255 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM90A2PQ658T7 463 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 PVRIGQ6DKI7 326 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR4A47Q6IF82 309 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF773Q6PK81 442 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 MMD2Q8IY49 270 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC38A6Q8IZM9 456 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM89BQ8N5H3 189 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 NKAIN3Q8N8D7 197 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 GIMAP1Q8WWP7 306 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 UQCC2Q9BRT2 126 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 RNF126Q9BV68 326 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 ETV7Q9Y603 341 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 KNCNA6PVL3 124 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 C11orf94C9JXX5 98 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 K7EIM0 57 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 CHEK1O14757 476 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 IGHV3-48P01763 117 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 CD37P11049 281 aa3.86□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.6 ms