RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 DCTN5Q9BTE1 182 aa5.86□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 FBXO7Q9Y3I1 522 aa5.86□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 TENM4Q6N022 2769 aa5.86□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 DEFB108AA8MXU0 73 aa5.86□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 VWC2LB2RUY7 222 aa5.86□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 TNFSF13O75888 250 aa5.86□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 IGKV3-15P01624 115 aa5.86□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 DYNLT3P51808 116 aa5.86□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 EDDM3AQ14507 147 aa5.86□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 GUK1Q16774 197 aa5.86□□□□□ -1.47
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HERC4-211ENST00000492996 BTNL8Q6UX41 500 aa5.86□□□□□ -1.47
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HERC4-211ENST00000492996 C1QL4Q86Z23 238 aa5.86□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 Q8IYB0 196 aa5.86□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 OR2Z1Q8NG97 314 aa5.86□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 OR52L2PQ8NGH6 319 aa5.86□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 CACNG5Q9UF02 275 aa5.86□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa5.85□□□□□ -1.47
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HERC4-211ENST00000492996 H0Y980 276 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 IGHV3-13P01766 116 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 IGHV3-7P01780 117 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 COX6B1P14854 86 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
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HERC4-211ENST00000492996 ZNF718Q3SXZ3 478 aa5.85□□□□□ -1.47
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HERC4-211ENST00000492996 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 PDZD2O15018 2839 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 M0R1B8 84 aa5.85□□□□□ -1.47
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HERC4-211ENST00000492996 IGKV1D-39P04432 117 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 OR4A8P0C604 315 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 ATP6V0CP27449 155 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 GLIPR1P48060 266 aa5.85□□□□□ -1.47
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HERC4-211ENST00000492996 LINC00205P59089 165 aa5.85□□□□□ -1.47
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HERC4-211ENST00000492996 SOHLH1Q5JUK2 328 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 ZNF880Q6PDB4 577 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 C1orf174Q8IYL3 243 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 OR4C5Q8NGB2 326 aa5.85□□□□□ -1.47
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HERC4-211ENST00000492996 OR2G3Q8NGZ4 309 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 SLC25A31Q9H0C2 315 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 PARP11Q9NR21 331 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 KCNIP1Q9NZI2 227 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa5.84□□□□□ -1.47
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HERC4-211ENST00000492996 C12orf77C9JDV5 145 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 IGLV2-14P01704 120 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 SEC11BP0C7V7 166 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 MDKP21741 143 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 GRNP28799 593 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 SSTR5P35346 364 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 RPS23P62266 143 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 ID3Q02535 119 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 MSMPQ1L6U9 139 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 WDR82Q6UXN9 313 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 DRAM1Q8N682 238 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 LRRC29Q8WV35 223 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 CABLES2Q9BTV7 478 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 IGF2RP11717 2491 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 KRASP01116 189 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 DANCRP0C864 163 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 MDH2P40926 338 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 COL10A1Q03692 680 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 C11orf71Q6IPW1 123 aa5.84□□□□□ -1.47
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HERC4-211ENST00000492996 GINS3Q9BRX5 216 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 OR2D2Q9H210 308 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
HERC4-211ENST00000492996 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa5.84□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa5.84□□□□□ -1.48
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HERC4-211ENST00000492996 HBZP02008 142 aa5.84□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 PAX9P55771 341 aa5.84□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 RPS16P62249 146 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 RPL19P84098 196 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 IQCJQ1A5X6 159 aa5.84□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 SPRNQ5BIV9 151 aa5.84□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa5.84□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 FAM201AQ5SY85 155 aa5.84□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 ACP7Q6ZNF0 438 aa5.84□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 ODF3L1Q8IXM7 274 aa5.84□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 TNFRSF14Q92956 283 aa5.84□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 GALMQ96C23 342 aa5.84□□□□□ -1.48
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