RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRNTQ86SH4 94 aa14.11□□□□□ -0.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa14.11□□□□□ -0.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RNF222A6NCQ9 220 aa14.11□□□□□ -0.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARF6P62330 175 aa14.11□□□□□ -0.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EFNB1P98172 346 aa14.11□□□□□ -0.15
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STXBP6Q8NFX7 210 aa14.11□□□□□ -0.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DCAF16Q9NXF7 216 aa14.1□□□□□ -0.15
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa14.1□□□□□ -0.15
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MEGF10Q96KG7 1140 aa14.09□□□□□ -0.15
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 APCSP02743 223 aa14.07□□□□□ -0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GUCD1Q96NT3 240 aa14.07□□□□□ -0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TBX15Q96SF7 602 aa14.07□□□□□ -0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM171Q8WVE6 324 aa14.07□□□□□ -0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa14.07□□□□□ -0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRR19A6NJB7 356 aa14.07□□□□□ -0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CRYBB3P26998 211 aa14.07□□□□□ -0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPL30P62888 115 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLCE1Q9P212 2302 aa14.07□□□□□ -0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF716A6NP11 495 aa14.07□□□□□ -0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MC5RP33032 325 aa14.07□□□□□ -0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa14.07□□□□□ -0.16
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM191AQ9H0A3 160 aa14.06□□□□□ -0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PARLQ9H300 379 aa14.06□□□□□ -0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM90A26D6RGX4 464 aa14.06□□□□□ -0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RRHO14718 337 aa14.06□□□□□ -0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KBTBD11O94819 623 aa14.06□□□□□ -0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TFF1P04155 84 aa14.06□□□□□ -0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TNFSF10P50591 281 aa14.06□□□□□ -0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM97Q5BJF2 176 aa14.06□□□□□ -0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
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