RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414879.5

PTPRF-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 2

Gene PTPRF, Length 4,836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-205	ENST00000414879	WDR82	Q6UXN9	313 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	SSX7	Q7RTT5	188 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879		U3KQA8	63 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	PLXNA2	O75051	1894 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879		A0A0G2JLM5	398 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	RHBDL1	O75783	438 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	C8orf88	P0DMB2	117 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	SSTR5	P35346	364 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	ATP5G2	Q06055	141 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	OR10C1	Q96KK4	312 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879		K7ENP7	123 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	FCN1	O00602	326 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	ISLR	O14498	428 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	TOX4	O94842	621 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	CXCL2	P19875	107 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	NTF3	P20783	257 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	LYZL4	Q96KX0	146 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	OOSP1	A8MZH6	123 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	PIP4P1	Q86T03	277 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	CHODL	Q9H9P2	273 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	SRRM5	B3KS81	715 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	PF4V1	P10720	104 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	ERVS71-1	P61550	626 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	SIGLEC5	O15389	551 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	MT-ND6	P03923	174 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	THBD	P07204	575 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	OR4C12	Q96R67	309 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	RABAC1	Q9UI14	185 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	FXYD3	Q14802	87 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879		A8MWL6	223 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	MEOX2	P50222	304 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	RND2	P52198	227 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	TMEM42	Q69YG0	159 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	CELA3B	P08861	270 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	AWAT1	Q58HT5	328 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	JMJD8	Q96S16	334 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	MOS	P00540	346 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	CA7	P43166	264 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	ZP1	P60852	638 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879		H3BQ15	152 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	DTX1	Q86Y01	620 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	TP53RK	Q96S44	253 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	RNF5	Q99942	180 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	PI4KA	P42356	2102 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	CCKAR	P32238	428 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	H2BFS	P57053	126 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	SST	P61278	116 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	RP1	P56715	2156 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	ZG16	O60844	167 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	DANCR	P0C864	163 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	SNCG	O76070	127 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	NMB	P08949	121 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	CFP	P27918	469 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	EFNA4	P52798	201 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	FAM166A	Q6J272	317 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	LRTM2	Q8N967	370 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-205	ENST00000414879	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		10.06	□□□□□ -0.8

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