RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639221.1

SLC35A3-216, Transcript of solute carrier family 35 member A3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC35A3, Length 1,032 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A3-216ENST00000639221 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
SLC35A3-216ENST00000639221 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
SLC35A3-216ENST00000639221 SALL1Q9NSC2 1324 aa27.57■■■□□ 2
SLC35A3-216ENST00000639221 HHIPL1Q96JK4 782 aa27.56■■■□□ 2
SLC35A3-216ENST00000639221 VEZTQ9HBM0 779 aa27.56■■■□□ 2
SLC35A3-216ENST00000639221 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa27.56■■■□□ 2
SLC35A3-216ENST00000639221 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa27.56■■■□□ 2
SLC35A3-216ENST00000639221 FKBP1BP68106 108 aa27.55■■■□□ 2
SLC35A3-216ENST00000639221 SAPCD2Q86UD0 394 aa27.55■■■□□ 2
SLC35A3-216ENST00000639221 SLF2Q8IX21 1173 aa27.55■■■□□ 2
SLC35A3-216ENST00000639221 JMYQ8N9B5 988 aa27.55■■■□□ 2
SLC35A3-216ENST00000639221 TMOD2Q9NZR1 351 aa27.55■■■□□ 2
SLC35A3-216ENST00000639221 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
SLC35A3-216ENST00000639221 TTC39AQ5SRH9 613 aa27.54■■■□□ 2
SLC35A3-216ENST00000639221 CEP350Q5VT06 3117 aa27.54■■■□□ 2
SLC35A3-216ENST00000639221 HHIPL2Q6UWX4 724 aa27.54■■■□□ 2
SLC35A3-216ENST00000639221 ARAP2Q8WZ64 1704 aa27.54■■■□□ 2
SLC35A3-216ENST00000639221 CLRN2A0PK11 232 aa27.53■■■□□ 2
SLC35A3-216ENST00000639221 RAB11FIP3O75154 756 aa27.53■■■□□ 2
SLC35A3-216ENST00000639221 TNNI2P48788 182 aa27.53■■■□□ 2
SLC35A3-216ENST00000639221 HUNKP57058 714 aa27.53■■■□□ 2
SLC35A3-216ENST00000639221 RASGRF1Q13972 1273 aa27.53■■■□□ 2
SLC35A3-216ENST00000639221 DEFB129Q9H1M3 183 aa27.53■■■□□ 2
SLC35A3-216ENST00000639221 ABCF2Q9UG63 623 aa27.53■■■□□ 2
SLC35A3-216ENST00000639221 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
SLC35A3-216ENST00000639221 MYH13Q9UKX3 1938 aa27.52■■■□□ 2
SLC35A3-216ENST00000639221 VEGFBP49765 207 aa27.52■■■□□ 2
SLC35A3-216ENST00000639221 DLK2Q6UY11 383 aa27.52■■■□□ 2
SLC35A3-216ENST00000639221 KIF1BPQ96EK5 621 aa27.52■■■□□ 2
SLC35A3-216ENST00000639221 ZDHHC15Q96MV8 337 aa27.52■■■□□ 2
SLC35A3-216ENST00000639221 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 GRIK5Q16478 980 aa27.51■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa27.51■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 SPDYE2Q495Y8 402 aa27.51■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 SPATA5Q8NB90 893 aa27.51■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa27.51■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 GRM1Q13255 1194 aa27.5■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 CAPNS2Q96L46 248 aa27.5■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 DBNDD2Q9BQY9 259 aa27.5■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 PRDX5P30044 214 aa27.49■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 ERICH6Q7L0X2 663 aa27.49■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 RHPN1Q8TCX5 695 aa27.49■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 HMG20BQ9P0W2 317 aa27.49■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 ARMC9Q7Z3E5 817 aa27.48■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 AACSQ86V21 672 aa27.48■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 APBB1O00213 710 aa27.47■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa27.47■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 CYP4F22Q6NT55 531 aa27.47■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 SIRT2Q8IXJ6 389 aa27.47■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 CCDC102AQ96A19 550 aa27.47■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 GSTO1P78417 241 aa27.46■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 RASA3Q14644 834 aa27.46■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 RGMBQ6NW40 437 aa27.46■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
SLC35A3-216ENST00000639221 LDHCP07864 332 aa27.45■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 LRP2BPQ9P2M1 347 aa27.45■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 ECM29Q5VYK3 1845 aa27.44■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 TCP10L2B9ZVM9 353 aa27.44■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 IGSF3O75054 1194 aa27.44■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 MAP2K2P36507 400 aa27.44■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 FKBP1CQ5VVH2 108 aa27.44■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa27.44■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 MCAMP43121 646 aa27.43■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 NOGQ13253 232 aa27.43■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 DIXDC1Q155Q3 683 aa27.43■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 AIDAQ96BJ3 306 aa27.43■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 HOOK2Q96ED9 719 aa27.43■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 RAI14Q9P0K7 980 aa27.43■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa27.43■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 AAMPQ13685 434 aa27.42■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 BEGAINQ9BUH8 593 aa27.42■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa27.42■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 FAM83AQ86UY5 434 aa27.41■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 LRRCC1Q9C099 1032 aa27.41■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 BCL11AQ9H165 835 aa27.4■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 SNRKQ9NRH2 765 aa27.4■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 USP40Q9NVE5 1235 aa27.4■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 AOX1Q06278 1338 aa27.4■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 UBE2Q2LH0YL09 131 aa27.39■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 MECOMQ03112 1051 aa27.39■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 PRKG1Q13976 671 aa27.39■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 PI16Q6UXB8 463 aa27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms