RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, human

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRD4-208	ENST00000597315	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
BRD4-208	ENST00000597315	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
BRD4-208	ENST00000597315	FKBP1B	P68106	108 aa		33.22	■■■□□ 2.91
BRD4-208	ENST00000597315	PDE3A	Q14432	1141 aa		33.22	■■■□□ 2.91
BRD4-208	ENST00000597315	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		33.22	■■■□□ 2.91
BRD4-208	ENST00000597315	CEP85	Q6P2H3	762 aa		33.22	■■■□□ 2.91
BRD4-208	ENST00000597315	AIDA	Q96BJ3	306 aa		33.21	■■■□□ 2.91
BRD4-208	ENST00000597315	TNFAIP1	Q13829	316 aa		33.2	■■■□□ 2.91
BRD4-208	ENST00000597315	GRIK5	Q16478	980 aa		33.2	■■■□□ 2.91
BRD4-208	ENST00000597315	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	33.2	■■■□□ 2.91
BRD4-208	ENST00000597315	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		33.2	■■■□□ 2.91
BRD4-208	ENST00000597315	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		33.2	■■■□□ 2.91
BRD4-208	ENST00000597315	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
BRD4-208	ENST00000597315	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
BRD4-208	ENST00000597315	RGMB	Q6NW40	437 aa		33.19	■■■□□ 2.9
BRD4-208	ENST00000597315	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
BRD4-208	ENST00000597315	MRI	Q9BWK5	157 aa		33.18	■■■□□ 2.9
BRD4-208	ENST00000597315	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
BRD4-208	ENST00000597315	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		33.17	■■■□□ 2.9
BRD4-208	ENST00000597315	HMMR	O75330	724 aa		33.17	■■■□□ 2.9
BRD4-208	ENST00000597315	GPR108	Q9NPR9	543 aa		33.17	■■■□□ 2.9
BRD4-208	ENST00000597315	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		33.17	■■■□□ 2.9
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
BRD4-208	ENST00000597315	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
BRD4-208	ENST00000597315	TNNI2	P48788	182 aa		33.16	■■■□□ 2.9
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
BRD4-208	ENST00000597315	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		33.16	■■■□□ 2.9
BRD4-208	ENST00000597315	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
BRD4-208	ENST00000597315	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		33.16	■■■□□ 2.9
BRD4-208	ENST00000597315	MAP2K2	P36507	400 aa		33.15	■■■□□ 2.9
BRD4-208	ENST00000597315	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		33.15	■■■□□ 2.9
BRD4-208	ENST00000597315	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		33.15	■■■□□ 2.9
BRD4-208	ENST00000597315	CCDC102A	Q96A19	550 aa		33.15	■■■□□ 2.9
BRD4-208	ENST00000597315	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		33.15	■■■□□ 2.9
BRD4-208	ENST00000597315	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		33.15	■■■□□ 2.9
BRD4-208	ENST00000597315	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
BRD4-208	ENST00000597315	RASGRF1	Q13972	1273 aa		33.14	■■■□□ 2.9
BRD4-208	ENST00000597315	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		33.14	■■■□□ 2.9
BRD4-208	ENST00000597315	TNNI3K	Q59H18	835 aa		33.14	■■■□□ 2.9
BRD4-208	ENST00000597315	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		33.14	■■■□□ 2.9
BRD4-208	ENST00000597315	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		33.14	■■■□□ 2.9
BRD4-208	ENST00000597315	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		33.14	■■■□□ 2.9
BRD4-208	ENST00000597315	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		33.14	■■■□□ 2.9
BRD4-208	ENST00000597315	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		33.14	■■■□□ 2.9
BRD4-208	ENST00000597315	ZBTB22	O15209	634 aa		33.13	■■■□□ 2.89
BRD4-208	ENST00000597315	AOC2	O75106	756 aa		33.13	■■■□□ 2.89
BRD4-208	ENST00000597315	NOG	Q13253	232 aa		33.13	■■■□□ 2.89
BRD4-208	ENST00000597315	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		33.13	■■■□□ 2.89
BRD4-208	ENST00000597315	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		33.13	■■■□□ 2.89
BRD4-208	ENST00000597315	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
BRD4-208	ENST00000597315	ABCF2	Q9UG63	623 aa		33.13	■■■□□ 2.89
BRD4-208	ENST00000597315	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
BRD4-208	ENST00000597315	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		33.12	■■■□□ 2.89
BRD4-208	ENST00000597315	PRDX5	P30044	214 aa		33.12	■■■□□ 2.89
BRD4-208	ENST00000597315	PRKG1	Q13976	671 aa		33.12	■■■□□ 2.89
BRD4-208	ENST00000597315	RASA3	Q14644	834 aa		33.12	■■■□□ 2.89
BRD4-208	ENST00000597315	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		33.11	■■■□□ 2.89
BRD4-208	ENST00000597315	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		33.11	■■■□□ 2.89
BRD4-208	ENST00000597315	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		33.11	■■■□□ 2.89
BRD4-208	ENST00000597315	AOX1	Q06278	1338 aa		33.1	■■■□□ 2.89
BRD4-208	ENST00000597315	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		33.1	■■■□□ 2.89
BRD4-208	ENST00000597315	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
BRD4-208	ENST00000597315	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
BRD4-208	ENST00000597315	WBP1L	Q9NX94	342 aa		33.1	■■■□□ 2.89
BRD4-208	ENST00000597315	MOB2	Q70IA6	237 aa		33.09	■■■□□ 2.89
BRD4-208	ENST00000597315	SLF2	Q8IX21	1173 aa		33.09	■■■□□ 2.89
BRD4-208	ENST00000597315	SPATA5	Q8NB90	893 aa		33.08	■■■□□ 2.89
BRD4-208	ENST00000597315	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
BRD4-208	ENST00000597315	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.88
BRD4-208	ENST00000597315	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		33.07	■■■□□ 2.88
BRD4-208	ENST00000597315	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		33.07	■■■□□ 2.88
BRD4-208	ENST00000597315	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	33.06	■■■□□ 2.88
BRD4-208	ENST00000597315	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		33.06	■■■□□ 2.88
BRD4-208	ENST00000597315	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		33.06	■■■□□ 2.88
BRD4-208	ENST00000597315	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
BRD4-208	ENST00000597315	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		33.05	■■■□□ 2.88
BRD4-208	ENST00000597315	SLC10A3	P09131	477 aa		33.04	■■■□□ 2.88
BRD4-208	ENST00000597315	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
BRD4-208	ENST00000597315	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		33.03	■■■□□ 2.88
BRD4-208	ENST00000597315	FOXN1	O15353	648 aa		33.03	■■■□□ 2.88
BRD4-208	ENST00000597315	CACNB3	P54284	484 aa		33.03	■■■□□ 2.88
BRD4-208	ENST00000597315	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
BRD4-208	ENST00000597315	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
BRD4-208	ENST00000597315	APBB1	O00213	710 aa		33.02	■■■□□ 2.88
BRD4-208	ENST00000597315	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
BRD4-208	ENST00000597315	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		33.02	■■■□□ 2.88
BRD4-208	ENST00000597315	PCNT	O95613	3336 aa		33.01	■■■□□ 2.88
BRD4-208	ENST00000597315	MCAM	P43121	646 aa		33.01	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	PI16	Q6UXB8	463 aa		33.01	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	AACS	Q86V21	672 aa		33.01	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		33.01	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		33.01	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		33.01	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		33.01	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	RAI14	Q9P0K7	980 aa		33.01	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	33.01	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		33.01	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	GSTO1	P78417	241 aa		33	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87

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