RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 COA1Q9GZY4 146 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 PDRG1Q9NUG6 133 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 WWC3Q9ULE0 1092 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 ZMYM6O95789 1325 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 LDHCP07864 332 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 ALX1Q15699 326 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 RASEFQ8IZ41 740 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 IRS2Q9Y4H2 1338 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF213O14771 459 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 LDHBP07195 334 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
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CAPNS1-212ENST00000591041 NEK1Q96PY6 1258 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 CHMP5Q9NZZ3 219 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 TRDNQ13061 729 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 CD209Q9NNX6 404 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.89■■□□□ 1.89
CAPNS1-212ENST00000591041 MBD4O95243 580 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-212ENST00000591041 SOGA3Q5TF21 947 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-212ENST00000591041 KLRK1P26718 216 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-212ENST00000591041 FGD1P98174 961 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-212ENST00000591041 NAPBQ9H115 298 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-212ENST00000591041 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-212ENST00000591041 BAG3O95817 575 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP21A2P08686 494 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-212ENST00000591041 RPS6KB1P23443 525 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-212ENST00000591041 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-212ENST00000591041 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-212ENST00000591041 MAST2Q6P0Q8 1798 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-212ENST00000591041 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-212ENST00000591041 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-212ENST00000591041 POLLQ9UGP5 575 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-212ENST00000591041 FGAP02671 866 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-212ENST00000591041 CHGBP05060 677 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-212ENST00000591041 TDO2P48775 406 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-212ENST00000591041 GIMAP6Q6P9H5 292 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-212ENST00000591041 TTLL6Q8N841 843 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-212ENST00000591041 TTC14Q96N46 770 aa26.84■■□□□ 1.89
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CAPNS1-212ENST00000591041 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-212ENST00000591041 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-212ENST00000591041 TGFB2P61812 414 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-212ENST00000591041 TXNRD3Q86VQ6 643 aa26.83■■□□□ 1.89
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CAPNS1-212ENST00000591041 SLFNL1Q499Z3 407 aa26.82■■□□□ 1.88
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CAPNS1-212ENST00000591041 RTKN2Q8IZC4 609 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 NCOA7Q8NI08 942 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 CNNM2Q9H8M5 875 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 ARMT1Q9H993 441 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 NT5C2P49902 561 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 AK2P54819 239 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 ADCK5Q3MIX3 580 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 PODNQ7Z5L7 613 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 AMOTL1Q8IY63 956 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 LTBP1Q14766 1721 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 E7EWF7 191 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 NUCB2P80303 420 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 CUL4AQ13619 759 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 IFNL3Q8IZI9 196 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 WDR19Q8NEZ3 1342 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 CEP350Q5VT06 3117 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 PCP11498 1178 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 CHRNA5P30532 468 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC93Q567U6 631 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 VPS33BQ9H267 617 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 MCM5P33992 734 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 MIGA1Q8NAN2 632 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 KRT23Q9C075 422 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 RIMBP2O15034 1052 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 LCORLQ8N3X6 602 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-212ENST00000591041 MFSD14BQ5SR56 506 aa26.76■■□□□ 1.87
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