RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 PROSER3Q2NL68 480 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 MUM1L1Q5H9M0 696 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC102BQ68D86 513 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 COPS6Q7L5N1 327 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 TMC6Q7Z403 805 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 TSC1Q92574 1164 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 RABGGTAQ92696 567 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC51Q96ER9 411 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 SIL1Q9H173 461 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 IFNKQ9P0W0 207 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 HPSEQ9Y251 543 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 USP16Q9Y5T5 823 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 TJP1Q07157 1748 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 PAPPAQ13219 1627 aa8.9□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 C4AP0C0L4 1744 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 C4BP0C0L5 1744 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 MAST3O60307 1309 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC151A5D8V7 595 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 ERLIN1O75477 346 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 SERPINC1P01008 464 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 PHKG2P15735 406 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 NDUFA8P51970 172 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 CASP7P55210 303 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 UBASH3AP57075 661 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 APOBRQ0VD83 1088 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 ELF2Q15723 593 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 NBPF11Q86T75 865 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 VSTM4Q8IW00 320 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 CTAGE1Q96RT6 745 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 DBNDD2Q9BQY9 259 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 CNNM2Q9H8M5 875 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 ARFGAP3Q9NP61 516 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 CEP126Q9P2H0 1117 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 MYO1AQ9UBC5 1043 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 GOLGA8BA8MQT2 603 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 GOLIM4O00461 696 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF213O14771 459 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 PRC1O43663 620 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 TADA3O75528 432 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 ANXA1P04083 346 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 PFKFB1P16118 471 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 CYP2C19P33261 490 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 TRIM14Q14142 442 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 RILPL1Q5EBL4 403 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 RESP18Q5W5W9 173 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 STOX1Q6ZVD7 989 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 LRP10Q7Z4F1 713 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 TMTC2Q8N394 836 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 CEP112Q8N8E3 955 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 TCEANC2Q96MN5 208 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 PANX2Q96RD6 677 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 PLA2G12BQ9BX93 195 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 C19orf44Q9H6X5 657 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 ADAMTSL3P82987 1691 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 COL18A1P39060 1754 aa8.87□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa8.87□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 IVLP07476 585 aa8.87□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 CASQ1P31415 396 aa8.87□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 LIFRP42702 1097 aa8.87□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 NCAPHQ15003 741 aa8.87□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 ALX1Q15699 326 aa8.87□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 DPCR1Q3MIW9 517 aa8.87□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 CFAP100Q494V2 611 aa8.87□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 TPRNQ4KMQ1 711 aa8.87□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 ESCO1Q5FWF5 840 aa8.87□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 GORABQ5T7V8 394 aa8.87□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 NT5DC1Q5TFE4 455 aa8.87□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa8.87□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 ARMCX5Q6P1M9 558 aa8.87□□□□□ -0.99
CAPNS1-202ENST00000586851 CTR9Q6PD62 1173 aa8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.2 ms