RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556980.5

XRCC3-217, Transcript of X-ray repair cross complementing 3, humanhuman

TSL 5

Gene XRCC3, Length 801 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC3-217ENST00000556980 PCNTO95613 3336 aa22.21■■□□□ 1.15
XRCC3-217ENST00000556980 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.21■■□□□ 1.15
XRCC3-217ENST00000556980 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
XRCC3-217ENST00000556980 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
XRCC3-217ENST00000556980 NOGQ13253 232 aa22.21■■□□□ 1.15
XRCC3-217ENST00000556980 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
XRCC3-217ENST00000556980 CCDC102BQ68D86 513 aa22.21■■□□□ 1.15
XRCC3-217ENST00000556980 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.21■■□□□ 1.15
XRCC3-217ENST00000556980 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.2■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 FOXN1O15353 648 aa22.2■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.2■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 CCDC102AQ96A19 550 aa22.2■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 XAGE2Q96GT9 111 aa22.2■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.2■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.2■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 TNFAIP1Q13829 316 aa22.19■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 GORABQ5T7V8 394 aa22.19■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 MOB2Q70IA6 237 aa22.19■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 CEP85Q6P2H3 762 aa22.18■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.18■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 COG6Q9Y2V7 657 aa22.18■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.17■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 RASGRF1Q13972 1273 aa22.17■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.17■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.17■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 MRIQ9BWK5 157 aa22.17■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.16■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 LDHBP07195 334 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 SLC10A3P09131 477 aa22.16■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 PRKG1Q13976 671 aa22.16■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 RASA3Q14644 834 aa22.16■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.16■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.15■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 ZBTB22O15209 634 aa22.15■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 PRDX5P30044 214 aa22.15■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 TNNI2P48788 182 aa22.15■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.15■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.15■■□□□ 1.14
XRCC3-217ENST00000556980 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.14■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 GPR108Q9NPR9 543 aa22.14■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.14■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 TNNI3KQ59H18 835 aa22.13■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 ZIC5Q96T25 663 aa22.13■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.13■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.12■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 CACNB3P54284 484 aa22.12■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 PDE3AQ14432 1141 aa22.12■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.12■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 ABCF2Q9UG63 623 aa22.12■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.12■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 CA12O43570 354 aa22.11■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 LBX1P52954 281 aa22.11■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.11■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 FZD1Q9UP38 647 aa22.11■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.11■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.1■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.1■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 SPATA5Q8NB90 893 aa22.1■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.1■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.1■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.1■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.1■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 HMMRO75330 724 aa22.09■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.09■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.09■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.09■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.09■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.09■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 MAP3K11Q16584 847 aa22.08■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.08■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.08■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 PI16Q6UXB8 463 aa22.08■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 SLF2Q8IX21 1173 aa22.08■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 TEPSINQ96N21 525 aa22.08■■□□□ 1.13
XRCC3-217ENST00000556980 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.07■■□□□ 1.12
XRCC3-217ENST00000556980 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.07■■□□□ 1.12
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