RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547449.1

CS-209, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-209ENST00000547449 TBC1D16Q8TBP0 767 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 CHMP4CQ96CF2 233 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 NACAP1Q9BZK3 213 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 ARMT1Q9H993 441 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 ZDHHC9Q9Y397 364 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 UFL1O94874 794 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 LARGE1O95461 756 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 IL1R1P14778 569 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 PTMSP20962 102 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 EVCP57679 992 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 STYK1Q6J9G0 422 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 LCORLQ8N3X6 602 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 CD209Q9NNX6 404 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 SMC3Q9UQE7 1217 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 DDX11L8A8MPP1 907 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 PFKFB2O60825 505 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 MCM5P33992 734 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 HAND2P61296 217 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 MECOMQ03112 1051 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 ST3GAL1Q11201 340 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 GIMAP6Q6P9H5 292 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 ADGRA1Q86SQ6 560 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 CCDC125Q86Z20 511 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 CCDC83Q8IWF9 413 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 ZNF384Q8TF68 577 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 TCEANC2Q96MN5 208 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 NAPBQ9H115 298 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 POLLQ9UGP5 575 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 H0YIN7 160 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 PRKAB2O43741 272 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 BAG4O95429 457 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 FGD1P98174 961 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 TRDNQ13061 729 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 MSL1Q68DK7 614 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 C2CD5Q86YS7 1000 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 MPNDQ8N594 471 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 NECAB1Q8N987 351 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 MIGA1Q8NAN2 632 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 SLC16A10Q8TF71 515 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 BRF1Q92994 677 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 NBPF3Q9H094 633 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 NRXN2Q9P2S2 1712 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 C6orf229H3BNL8 230 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 LDHCP07864 332 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 PPP4CP60510 307 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 GSTO1P78417 241 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 PKP1Q13835 747 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 SLC51AQ86UW1 340 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 GTF3C6Q969F1 213 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 MTA3Q9BTC8 594 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 COA1Q9GZY4 146 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 ANAPC4Q9UJX5 808 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 FAM205AQ6ZU69 1335 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 TAF1P21675 1872 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 GOLGA6L22H0YM25 854 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 PRC1O43663 620 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 LDHBP07195 334 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 PDCP20941 246 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 SYT1P21579 422 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 GJB2P29033 226 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 PRDX5P30044 214 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 TDO2P48775 406 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 ANTXR2P58335 489 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 AKNAD1Q5T1N1 836 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 TBC1D10CQ8IV04 446 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 CNKSR1Q969H4 720 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 LRRC2Q9BYS8 371 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 KRT23Q9C075 422 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 CNNM2Q9H8M5 875 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-209ENST00000547449 A0A1B0GUL6 1792 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-209ENST00000547449 DOCK2Q92608 1830 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-209ENST00000547449 STX6O43752 255 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-209ENST00000547449 FGRP09769 529 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-209ENST00000547449 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
CS-209ENST00000547449 APOBRQ0VD83 1088 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-209ENST00000547449 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
CS-209ENST00000547449 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms