RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516658.1

RNU6-347P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 347, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-347P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-347P-201ENST00000516658 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 FAM169BQ8N8A8 192 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 EHBP1Q8NDI1 1231 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 TTC8Q8TAM2 541 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 AIDAQ96BJ3 306 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 SLC5A4Q9NY91 659 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 SLC12A7Q9Y666 1083 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 MEN1O00255 615 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 EREGO14944 169 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 APPP05067 770 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 BCAMP50895 628 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 MCL1Q07820 350 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 MORC3Q14149 939 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 GRAMD1BQ3KR37 738 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 GK5Q6ZS86 529 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 SPATC1Q76KD6 591 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 NECAB2Q7Z6G3 386 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 PCGF5Q86SE9 256 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 IFNL3Q8IZI9 196 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 C3orf58Q8NDZ4 430 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 SVIPQ8NHG7 77 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 KIF2CQ99661 725 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 CDC6Q99741 560 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 MTA3Q9BTC8 594 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 SPATA9Q9BWV2 254 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 CASS4Q9NQ75 786 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 PRDM10Q9NQV6 1147 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 INTUQ9ULD6 942 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 SPEF1Q9Y4P9 236 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 USP3Q9Y6I4 520 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 POTEB3A0JP26 581 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 PHF20L1A8MW92 1017 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 TBX3O15119 743 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 FBXO24O75426 580 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 KATNA1O75449 491 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 FGAP02671 866 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 GARTP22102 1010 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 CRKP46108 304 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 TRAPPC10P48553 1259 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 NR5A1Q13285 461 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 CLN3Q13286 438 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 MLECQ14165 292 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 MPP2Q14168 576 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 NCAPHQ15003 741 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 MLC1Q15049 377 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 LRRC41Q15345 812 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 HGSNATQ68CP4 663 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 CNNM4Q6P4Q7 775 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 POTEBQ6S5H4 581 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 AGMOQ6ZNB7 445 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 PDILTQ8N807 584 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 C1orf127Q8N9H9 656 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 WDR66Q8TBY9 1149 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 RHBDD1Q8TEB9 315 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 WNT2BQ93097 391 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 MTMR8Q96EF0 704 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 SUSD3Q96L08 255 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 PAGR1Q9BTK6 254 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 PPCSQ9HAB8 311 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 LIN7BQ9HAP6 207 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 TMEM63CQ9P1W3 806 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZNF180Q9UJW8 692 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 A0A087X0B3 334 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 A0A1W2PP55 124 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 AKAP10O43572 662 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 TLL1O43897 1013 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 LILRA1O75019 489 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 XYLBO75191 536 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 FAM153BP0C7A2 387 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 ARAFP10398 606 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 BDNFP23560 247 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 CCDC70Q6NSX1 233 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 NLRP13Q86W25 1043 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 TRIM42Q8IWZ5 723 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 PPM1KQ8N3J5 372 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 GATAD2BQ8WXI9 593 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 CHMP4CQ96CF2 233 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 CDK15Q96Q40 435 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 LRRC3Q9BY71 257 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 EPN3Q9H201 632 aa5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms