RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516099.1

RNU6-491P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 491, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-491P, Length 110 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-491P-201ENST00000516099 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 CPB1P15086 417 aa8.26□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 ETFBP38117 255 aa8.26□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 APOBRQ0VD83 1088 aa8.26□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 LINC00114Q6XXX2 140 aa8.26□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 FAM35AQ86V20 835 aa8.26□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 DCAF5Q96JK2 942 aa8.26□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.26□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa8.26□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 TLR3O15455 904 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 CRKP46108 304 aa8.25□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 SOX9P48436 509 aa8.25□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 PCSK7Q16549 785 aa8.25□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa8.25□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa8.25□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 MICALL1Q8N3F8 863 aa8.25□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa8.25□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 CPLX3Q8WVH0 158 aa8.25□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 BSNDQ8WZ55 320 aa8.25□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 NKD1Q969G9 470 aa8.25□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 TLDC2A0PJX2 215 aa8.24□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 F13A1P00488 732 aa8.24□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 ARAFP10398 606 aa8.24□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 EPXP11678 715 aa8.24□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 LMNB1P20700 586 aa8.24□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 PPP2R3AQ06190 1150 aa8.24□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 SEZ6Q53EL9 994 aa8.24□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 RASIP1Q5U651 963 aa8.24□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 ANKS3Q6ZW76 656 aa8.24□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 FCHSD1Q86WN1 690 aa8.24□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 FBXO27Q8NI29 283 aa8.24□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 PLD4Q96BZ4 506 aa8.24□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 ANAPC16Q96DE5 110 aa8.24□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 NEURL1BA8MQ27 555 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 BMP6P22004 513 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 COL8A1P27658 744 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 RPS26P62854 115 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 PCDH1Q08174 1060 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 FAM196AQ6ZSG2 479 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 BTBD6Q96KE9 485 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 MDFIQ99750 246 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 LACRTQ9GZZ8 138 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 SLC6A14Q9UN76 642 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 SIN3BO75182 1162 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 PERM1Q5SV97 790 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 CCDC81Q6ZN84 652 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 TRIM42Q8IWZ5 723 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 STRIP2Q9ULQ0 834 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 TRIM33Q9UPN9 1127 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 PTPRAP18433 802 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 MCM4P33991 863 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 SEPT6Q14141 434 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 VN1R5Q7Z5H4 357 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 SLITRK4Q8IW52 837 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 STK35Q8TDR2 534 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 CBX8Q9HC52 389 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 NAGPAQ9UK23 515 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 PPT2Q9UMR5 302 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 SAMM50Q9Y512 469 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 NME2P22392 152 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 SULF2Q8IWU5 870 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 GATAD2BQ8WXI9 593 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 SOX13Q9UN79 622 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 ROBO2Q9HCK4 1378 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 KRBA1A5PL33 1030 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 B3GALT4O96024 378 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 ADH7P40394 386 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 DGKGP49619 791 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 SERINC3Q13530 473 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 NFE2L2Q16236 605 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 NBPF6Q5VWK0 638 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 FBXW10Q5XX13 1052 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 SDE2Q6IQ49 451 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
RNU6-491P-201ENST00000516099 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms