RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 DSCC1Q9BVC3 393 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 CLSTN1O94985 981 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 DDB1Q16531 1140 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 STAMQ92783 540 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 SMARCE1Q969G3 411 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 CLIC6Q96NY7 704 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 GSDMDP57764 484 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 NLRP5P59047 1200 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 KRT40Q6A162 431 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 PHKA1P46020 1223 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 GNG11P61952 73 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 MYSM1Q5VVJ2 828 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 VAT1LQ9HCJ6 419 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 CABP5Q9NP86 173 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 NRKQ7Z2Y5 1582 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 TXLNAP40222 546 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 MKNK2Q9HBH9 465 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 NBPF26B4DH59 902 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 NEMFO60524 1076 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 KCNQ4P56696 695 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 NBPF14Q5TI25 921 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 NBPF15Q8N660 670 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
RABGEF1-211ENST00000503687 TSPY2A6NKD2 308 aa14.71□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 USP5P45974 858 aa14.71□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 CATIPQ7Z7H3 387 aa14.71□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa14.71□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 DACH1Q9UI36 760 aa14.71□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 TRERF1Q96PN7 1200 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 RESTQ13127 1097 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 PNOCQ13519 176 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF827Q17R98 1081 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 PLIN2Q99541 437 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 STX8Q9UNK0 236 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 PDIA6Q15084 440 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 KIAA1524Q8TCG1 905 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 KARSQ15046 597 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 KIF20BQ96Q89 1820 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 GOLGA8FQ08AF8 430 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 SCARF1Q14162 830 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 DPCR1Q3MIW9 517 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 BRAPQ7Z569 592 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 UBAP1LF5GYI3 381 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 ZHX3Q9H4I2 956 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 BCAMP50895 628 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM87AQ8NBN3 555 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 KIAA1468Q9P260 1216 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 CEP131Q9UPN4 1083 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 CCP110O43303 1012 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 PFKFB1P16118 471 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 SDR42E1Q8WUS8 393 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 BTBD18B2RXH4 712 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 KCNH3Q9ULD8 1083 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 PDE6AP16499 860 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 FANCCQ00597 558 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF174Q15697 407 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 HLFQ16534 295 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM182BQ5T319 152 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 ADALQ6DHV7 355 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 KRT23Q9C075 422 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 ITSN1Q15811 1721 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 C1orf167Q5SNV9 1468 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 CAGE1Q8TC20 777 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 ESR2Q92731 530 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms