RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 WWC3Q9ULE0 1092 aa9.7□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 PFKFB2O60825 505 aa9.7□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 BCAMP50895 628 aa9.7□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 FGD1P98174 961 aa9.7□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 MAP3K12Q12852 859 aa9.7□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP9.69□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 NCLP19338 710 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF445P59923 1031 aa9.69□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 TPTE2Q6XPS3 522 aa9.69□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 GAS2L3Q86XJ1 694 aa9.69□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 NLRP3Q96P20 1036 aa9.69□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 ZMYM6O95789 1325 aa9.69□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 CACNA1SQ13698 1873 aa9.69□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF213O14771 459 aa9.68□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 DTNBO60941 627 aa9.68□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 EVCP57679 992 aa9.68□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 HAND2P61296 217 aa9.68□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 SCRN1Q12765 414 aa9.68□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 GRPEL1Q9HAV7 217 aa9.68□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 MINPP1Q9UNW1 487 aa9.68□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 TIAM2Q8IVF5 1701 aa9.68□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa9.68□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 WDR19Q8NEZ3 1342 aa9.68□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa9.68□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 USP48Q86UV5 1035 aa9.68□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 MAGEB6Q8N7X4 407 aa9.68□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 NCOA7Q8NI08 942 aa9.68□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa9.68□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 AIDAQ96BJ3 306 aa9.68□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 SPON1Q9HCB6 807 aa9.68□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 MMP10P09238 476 aa9.67□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 APOBRQ0VD83 1088 aa9.67□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 NFIXQ14938 502 aa9.67□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 ALX1Q15699 326 aa9.67□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 GDPD2Q9HCC8 539 aa9.67□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 CNPY2Q9Y2B0 182 aa9.67□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 JAK2O60674 1132 aa9.67□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 POLD1P28340 1107 aa9.67□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 MCM5P33992 734 aa9.67□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 RPS8P62241 208 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 CDC37L1Q7L3B6 337 aa9.67□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM63CQ9P1W3 806 aa9.67□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 CARMIL3Q8ND23 1372 aa9.67□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 CHST3Q7LGC8 479 aa9.66□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 CHMP4CQ96CF2 233 aa9.66□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 NBPF3Q9H094 633 aa9.66□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 BRPF3Q9ULD4 1205 aa9.66□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 PARP3Q9Y6F1 533 aa9.66□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa9.66□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 MAST2Q6P0Q8 1798 aa9.66□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 PRC1O43663 620 aa9.66□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 TM4SF1P30408 202 aa9.66□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 GYG1P46976 350 aa9.66□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.66□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 CAVIN4Q5BKX8 364 aa9.66□□□□□ -0.86
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PDE4D-208ENST00000502484 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 SALL1Q9NSC2 1324 aa9.66□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 NPHP1O15259 732 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 MBD4O95243 580 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 CTDNEP1O95476 244 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 APPP05067 770 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 ANTXR2P58335 489 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 TBC1D10CQ8IV04 446 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 ANKRD2Q9GZV1 360 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 LRP2BPQ9P2M1 347 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
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PDE4D-208ENST00000502484 GNAT2P19087 354 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 PTGER2P43116 358 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 UBE2HP62256 183 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 DDR1Q08345 913 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 TRDNQ13061 729 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 IFNL3Q8IZI9 196 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 DENND2AQ9ULE3 1009 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
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