RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487034.5

RPL13-208, Transcript of ribosomal protein L13, human

TSL 1 (best)

Gene RPL13, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL13-208	ENST00000487034	CIAO1	O76071	339 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RPL13-208	ENST00000487034	CRK	P46108	304 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RPL13-208	ENST00000487034	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
RPL13-208	ENST00000487034	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RPL13-208	ENST00000487034	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RPL13-208	ENST00000487034	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RPL13-208	ENST00000487034	VEZT	Q9HBM0	779 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RPL13-208	ENST00000487034	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
RPL13-208	ENST00000487034	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
RPL13-208	ENST00000487034	HTT	P42858	3142 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RPL13-208	ENST00000487034	RASA3	Q14644	834 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RPL13-208	ENST00000487034	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
RPL13-208	ENST00000487034	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RPL13-208	ENST00000487034	VPS37D	Q86XT2	251 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RPL13-208	ENST00000487034	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
RPL13-208	ENST00000487034	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
RPL13-208	ENST00000487034	SIL1	Q9H173	461 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RPL13-208	ENST00000487034	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
RPL13-208	ENST00000487034	FBXO3	Q9UK99	471 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RPL13-208	ENST00000487034	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	27.82	■■■□□ 2.04
RPL13-208	ENST00000487034	LPIN2	Q92539	896 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RPL13-208	ENST00000487034	TEPSIN	Q96N21	525 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RPL13-208	ENST00000487034	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RPL13-208	ENST00000487034	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
RPL13-208	ENST00000487034	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
RPL13-208	ENST00000487034	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
RPL13-208	ENST00000487034	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RPL13-208	ENST00000487034	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RPL13-208	ENST00000487034	TM4SF4	P48230	202 aa		27.8	■■■□□ 2.04
RPL13-208	ENST00000487034	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
RPL13-208	ENST00000487034	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
RPL13-208	ENST00000487034	PDE3A	Q14432	1141 aa		27.8	■■■□□ 2.04
RPL13-208	ENST00000487034	SPRYD7	Q5W111	196 aa		27.8	■■■□□ 2.04
RPL13-208	ENST00000487034	COPRS	Q9NQ92	184 aa		27.8	■■■□□ 2.04
RPL13-208	ENST00000487034	GNAI2	P04899	355 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RPL13-208	ENST00000487034	SLC5A1	P13866	664 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RPL13-208	ENST00000487034	MTX1	Q13505	466 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RPL13-208	ENST00000487034	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
RPL13-208	ENST00000487034	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		27.78	■■■□□ 2.04
RPL13-208	ENST00000487034	ATP2B3	Q16720	1220 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RPL13-208	ENST00000487034	COG6	Q9Y2V7	657 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RPL13-208	ENST00000487034	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	TNFAIP1	Q13829	316 aa		27.76	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		27.76	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		27.76	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		27.76	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		27.76	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	GJA5	P36382	358 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	DGKZ	Q13574	1117 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	TEKT1	Q969V4	418 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	WNK4	Q96J92	1243 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	ZBTB22	O15209	634 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	CACNB3	P54284	484 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	MRI	Q9BWK5	157 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	UNCX	A6NJT0	531 aa		27.73	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	ADORA1	P30542	326 aa		27.73	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	PHKA1	P46020	1223 aa		27.73	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		27.73	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		27.73	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	TBC1D8	O95759	1140 aa		27.72	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	SREBF2	Q12772	1141 aa		27.72	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		27.72	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	MAST3	O60307	1309 aa		27.71	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	PRDX5	P30044	214 aa		27.71	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		27.71	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		27.71	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		27.71	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		27.7	■■■□□ 2.03
RPL13-208	ENST00000487034	SRGAP3	O43295	1099 aa		27.7	■■■□□ 2.02
RPL13-208	ENST00000487034	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
RPL13-208	ENST00000487034	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		27.7	■■■□□ 2.02
RPL13-208	ENST00000487034	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
RPL13-208	ENST00000487034	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
RPL13-208	ENST00000487034	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
RPL13-208	ENST00000487034	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		27.69	■■■□□ 2.02
RPL13-208	ENST00000487034	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
RPL13-208	ENST00000487034	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		27.68	■■■□□ 2.02
RPL13-208	ENST00000487034	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	27.68	■■■□□ 2.02
RPL13-208	ENST00000487034	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		27.68	■■■□□ 2.02
RPL13-208	ENST00000487034	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		27.68	■■■□□ 2.02
RPL13-208	ENST00000487034	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	27.68	■■■□□ 2.02
RPL13-208	ENST00000487034	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		27.68	■■■□□ 2.02
RPL13-208	ENST00000487034	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		27.68	■■■□□ 2.02
RPL13-208	ENST00000487034	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
RPL13-208	ENST00000487034	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		27.67	■■■□□ 2.02
RPL13-208	ENST00000487034	CCDC102B	Q68D86	513 aa		27.67	■■■□□ 2.02
RPL13-208	ENST00000487034	FAM83A	Q86UY5	434 aa		27.67	■■■□□ 2.02
RPL13-208	ENST00000487034	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		27.66	■■■□□ 2.02
RPL13-208	ENST00000487034	SEMA3E	O15041	775 aa		27.66	■■■□□ 2.02
RPL13-208	ENST00000487034	ATP8B2	P98198	1209 aa		27.66	■■■□□ 2.02

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