RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SHTN1A0MZ66 631 aa18.84■□□□□ 0.61
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa18.84■□□□□ 0.61
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa18.84■□□□□ 0.61
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa18.84■□□□□ 0.61
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLU7O95391 586 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CALML3P27482 149 aa18.84■□□□□ 0.61
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CTR9Q6PD62 1173 aa18.84■□□□□ 0.61
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARFGAP3Q9NP61 516 aa18.84■□□□□ 0.61
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP18.84■□□□□ 0.619e-7■■■□□ 15.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HS1BP3Q53T59 392 aa18.83■□□□□ 0.61
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SSH3Q8TE77 659 aa18.83■□□□□ 0.61
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LDHBP07195 334 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.61
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.61
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ME3Q16798 604 aa18.83■□□□□ 0.61
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