RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470965.1

HDAC10-208, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 810 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-208	ENST00000470965	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		24.42	■■□□□ 1.5
HDAC10-208	ENST00000470965	APBB1	O00213	710 aa		24.42	■■□□□ 1.5
HDAC10-208	ENST00000470965	IGSF3	O75054	1194 aa		24.42	■■□□□ 1.5
HDAC10-208	ENST00000470965	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	24.42	■■□□□ 1.5
HDAC10-208	ENST00000470965	MCAM	P43121	646 aa		24.42	■■□□□ 1.5
HDAC10-208	ENST00000470965	CRK	P46108	304 aa		24.42	■■□□□ 1.5
HDAC10-208	ENST00000470965	GRIK5	Q16478	980 aa		24.42	■■□□□ 1.5
HDAC10-208	ENST00000470965	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		24.42	■■□□□ 1.5
HDAC10-208	ENST00000470965	USP48	Q86UV5	1035 aa		24.42	■■□□□ 1.5
HDAC10-208	ENST00000470965	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	24.42	■■□□□ 1.5
HDAC10-208	ENST00000470965	CREBZF	Q9NS37	354 aa		24.42	■■□□□ 1.5
HDAC10-208	ENST00000470965	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	24.41	■■□□□ 1.5
HDAC10-208	ENST00000470965	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	24.41	■■□□□ 1.5
HDAC10-208	ENST00000470965	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	24.4	■■□□□ 1.5
HDAC10-208	ENST00000470965	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		24.4	■■□□□ 1.5
HDAC10-208	ENST00000470965	PRDX5	P30044	214 aa		24.4	■■□□□ 1.5
HDAC10-208	ENST00000470965	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		24.4	■■□□□ 1.5
HDAC10-208	ENST00000470965	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	24.4	■■□□□ 1.5
HDAC10-208	ENST00000470965	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		24.4	■■□□□ 1.5
HDAC10-208	ENST00000470965	TRAF5	O00463	557 aa		24.39	■■□□□ 1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	SLF2	Q8IX21	1173 aa		24.39	■■□□□ 1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	ABCF2	Q9UG63	623 aa		24.39	■■□□□ 1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		24.38	■■□□□ 1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	ADM5	C9JUS6	153 aa		24.37	■■□□□ 1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		24.37	■■□□□ 1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	PI16	Q6UXB8	463 aa		24.37	■■□□□ 1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	24.37	■■□□□ 1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	24.37	■■□□□ 1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	GCC1	Q96CN9	775 aa		24.37	■■□□□ 1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		24.37	■■□□□ 1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		24.37	■■□□□ 1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	TNFAIP1	Q13829	316 aa		24.36	■■□□□ 1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	24.35	■■□□□ 1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	24.35	■■□□□ 1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	GSTO1	P78417	241 aa		24.34	■■□□□ 1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	CST9	Q5W186	159 aa		24.34	■■□□□ 1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	24.34	■■□□□ 1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	CDCA5	Q96FF9	252 aa		24.34	■■□□□ 1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	24.34	■■□□□ 1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		24.34	■■□□□ 1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	24.34	■■□□□ 1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		24.34	■■□□□ 1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	GAK	O14976	1311 aa		24.34	■■□□□ 1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	CLRN2	A0PK11	232 aa		24.33	■■□□□ 1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	ZAP70	P43403	619 aa		24.33	■■□□□ 1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	24.33	■■□□□ 1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		24.33	■■□□□ 1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	24.33	■■□□□ 1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	VEZT	Q9HBM0	779 aa		24.33	■■□□□ 1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	SNRK	Q9NRH2	765 aa		24.33	■■□□□ 1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		24.33	■■□□□ 1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	24.32	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	24.32	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	LDHC	P07864	332 aa		24.32	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	MECOM	Q03112	1051 aa		24.32	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		24.32	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	24.32	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		24.32	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	RAI14	Q9P0K7	980 aa		24.32	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	24.32	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	ATP5J	P18859	108 aa		24.31	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	NF2	P35240	595 aa		24.31	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	TNNI2	P48788	182 aa		24.31	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		24.31	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	24.31	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	GPATCH3	Q96I76	525 aa		24.31	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		24.31	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		24.31	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	FKBP1B	P68106	108 aa		24.3	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	24.3	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		24.3	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		24.3	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	AOX1	Q06278	1338 aa		24.3	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		24.3	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		24.29	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	BCL11A	Q9H165	835 aa		24.29	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	24.29	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	24.29	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		24.29	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	RASSF10	A6NK89	507 aa		24.28	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	24.28	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	HTRA3	P83110	453 aa		24.28	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	RASA3	Q14644	834 aa		24.28	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	DLK2	Q6UY11	383 aa		24.28	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	FAM83A	Q86UY5	434 aa		24.28	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		24.28	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		24.28	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	24.28	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	24.27	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		24.27	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	24.27	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		24.27	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	SMC5	Q8IY18	1101 aa		24.27	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		24.27	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	24.27	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	CNTNAP1	P78357	1384 aa		24.27	■■□□□ 1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		24.26	■■□□□ 1.47
HDAC10-208	ENST00000470965	MAP3K12	Q12852	859 aa		24.26	■■□□□ 1.47
HDAC10-208	ENST00000470965	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		24.26	■■□□□ 1.47
HDAC10-208	ENST00000470965	ZNF384	Q8TF68	577 aa		24.26	■■□□□ 1.47

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