RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462743.1

HPS1-206, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene HPS1, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-206ENST00000462743 ZDHHC15Q96MV8 337 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 CRBNQ96SW2 442 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 DBNDD2Q9BQY9 259 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 HMG20BQ9P0W2 317 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 ECM29Q5VYK3 1845 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 MYO1BO43795 1136 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 HTRA3P83110 453 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 SPATA5Q8NB90 893 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 TEKT1Q969V4 418 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 KLRG1Q96E93 195 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 RASSF10A6NK89 507 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 ADM5C9JUS6 153 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 CELF2O95319 508 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 LDHBP07195 334 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 MCAMP43121 646 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 SPDYE2Q495Y8 402 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 FKBP1CQ5VVH2 108 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 HHIPL1Q96JK4 782 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 PRDX5P30044 214 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 FKBP1BP68106 108 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 TTC39AQ5SRH9 613 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 CDCA5Q96FF9 252 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 TLL2Q9Y6L7 1015 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 DEFB115Q30KQ5 88 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 DLK2Q6UY11 383 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 SAPCD2Q86UD0 394 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 AACSQ86V21 672 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 SLF2Q8IX21 1173 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 JMYQ8N9B5 988 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 DEFB129Q9H1M3 183 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 MYH2Q9UKX2 1941 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 ERICH6Q7L0X2 663 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 C2orf69Q8N8R5 385 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 LRRCC1Q9C099 1032 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 ABCF2Q9UG63 623 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 GAKO14976 1311 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 AOX1Q06278 1338 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 CNTNAP1P78357 1384 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 LDHCP07864 332 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 TNFAIP1Q13829 316 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 PI16Q6UXB8 463 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 CLRN2A0PK11 232 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 DIXDC1Q155Q3 683 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 FAM83AQ86UY5 434 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 ZNF384Q8TF68 577 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
HPS1-206ENST00000462743 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-206ENST00000462743 UNCXA6NJT0 531 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-206ENST00000462743 NF2P35240 595 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-206ENST00000462743 ZAP70P43403 619 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-206ENST00000462743 TNNI2P48788 182 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-206ENST00000462743 GSTO1P78417 241 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-206ENST00000462743 MECOMQ03112 1051 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-206ENST00000462743 RASA3Q14644 834 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-206ENST00000462743 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-206ENST00000462743 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-206ENST00000462743 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-206ENST00000462743 ZNF408Q9H9D4 720 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-206ENST00000462743 VEZTQ9HBM0 779 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-206ENST00000462743 SNRKQ9NRH2 765 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-206ENST00000462743 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
HPS1-206ENST00000462743 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
HPS1-206ENST00000462743 APBB1O00213 710 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-206ENST00000462743 ATP5JP18859 108 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-206ENST00000462743 ECE1P42892 770 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-206ENST00000462743 VEGFBP49765 207 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-206ENST00000462743 MAP3K11Q16584 847 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-206ENST00000462743 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-206ENST00000462743 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
HPS1-206ENST00000462743 TEPSINQ96N21 525 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-206ENST00000462743 LRP2BPQ9P2M1 347 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-206ENST00000462743 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
HPS1-206ENST00000462743 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-206ENST00000462743 NPM3O75607 178 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HPS1-206ENST00000462743 HUNKP57058 714 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-206ENST00000462743 PPP4CP60510 307 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.6 ms