RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa29.18■■■□□ 2.26
NME4-209ENST00000460297 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
NME4-209ENST00000460297 YDJCA8MPS7 323 aa29.17■■■□□ 2.26
NME4-209ENST00000460297 TBC1D32Q96NH3 1257 aa29.17■■■□□ 2.26
NME4-209ENST00000460297 PSME4Q14997 1843 aa29.17■■■□□ 2.26
NME4-209ENST00000460297 LTBP3Q9NS15 1303 aa29.17■■■□□ 2.26
NME4-209ENST00000460297 LDHBP07195 334 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
NME4-209ENST00000460297 PTH1RQ03431 593 aa29.16■■■□□ 2.26
NME4-209ENST00000460297 ADGRA1Q86SQ6 560 aa29.16■■■□□ 2.26
NME4-209ENST00000460297 FBXW7Q969H0 707 aa29.16■■■□□ 2.26
NME4-209ENST00000460297 C22orf23Q9BZE7 217 aa29.16■■■□□ 2.26
NME4-209ENST00000460297 UTRNP46939 3433 aa29.16■■■□□ 2.26
NME4-209ENST00000460297 CCDC171Q6TFL3 1326 aa29.16■■■□□ 2.26
NME4-209ENST00000460297 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa29.15■■■□□ 2.26
NME4-209ENST00000460297 CERS5Q8N5B7 392 aa29.15■■■□□ 2.26
NME4-209ENST00000460297 CYP7A1P22680 504 aa29.15■■■□□ 2.26
NME4-209ENST00000460297 RASSF7Q02833 373 aa29.15■■■□□ 2.26
NME4-209ENST00000460297 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
NME4-209ENST00000460297 MXD3Q9BW11 206 aa29.15■■■□□ 2.26
NME4-209ENST00000460297 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
NME4-209ENST00000460297 STRIP1Q5VSL9 837 aa29.13■■■□□ 2.25
NME4-209ENST00000460297 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
NME4-209ENST00000460297 MYH2Q9UKX2 1941 aa29.13■■■□□ 2.25
NME4-209ENST00000460297 IGSF3O75054 1194 aa29.12■■■□□ 2.25
NME4-209ENST00000460297 PRELPP51888 382 aa29.12■■■□□ 2.25
NME4-209ENST00000460297 USP17L3A6NCW0 530 aa29.12■■■□□ 2.25
NME4-209ENST00000460297 USP17L4A6NCW7 530 aa29.12■■■□□ 2.25
NME4-209ENST00000460297 GPAA1O43292 621 aa29.12■■■□□ 2.25
NME4-209ENST00000460297 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
NME4-209ENST00000460297 RBM25P49756 843 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
NME4-209ENST00000460297 DACT2Q5SW24 774 aa29.12■■■□□ 2.25
NME4-209ENST00000460297 USP17L1Q7RTZ2 530 aa29.12■■■□□ 2.25
NME4-209ENST00000460297 VPS53Q5VIR6 699 aa29.11■■■□□ 2.25
NME4-209ENST00000460297 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
NME4-209ENST00000460297 NIM1KQ8IY84 436 aa29.1■■■□□ 2.25
NME4-209ENST00000460297 MIGA1Q8NAN2 632 aa29.1■■■□□ 2.25
NME4-209ENST00000460297 MAP4K1Q92918 833 aa29.1■■■□□ 2.25
NME4-209ENST00000460297 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP29.09■■■□□ 2.256e-11■□□□□ 10
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NME4-209ENST00000460297 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa29.09■■■□□ 2.25
NME4-209ENST00000460297 MBD4O95243 580 aa29.09■■■□□ 2.25
NME4-209ENST00000460297 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
NME4-209ENST00000460297 DIXDC1Q155Q3 683 aa29.09■■■□□ 2.25
NME4-209ENST00000460297 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa29.09■■■□□ 2.25
NME4-209ENST00000460297 AIDAQ96BJ3 306 aa29.09■■■□□ 2.25
NME4-209ENST00000460297 FOXP2O15409 715 aa29.08■■■□□ 2.25
NME4-209ENST00000460297 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
NME4-209ENST00000460297 ARMT1Q9H993 441 aa29.08■■■□□ 2.25
NME4-209ENST00000460297 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
NME4-209ENST00000460297 LCORLQ8N3X6 602 aa29.07■■■□□ 2.24
NME4-209ENST00000460297 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
NME4-209ENST00000460297 SBF1O95248 1867 aa29.07■■■□□ 2.24
NME4-209ENST00000460297 RAD17O75943 681 aa29.06■■■□□ 2.24
NME4-209ENST00000460297 JDP2Q8WYK2 163 aa29.06■■■□□ 2.24
NME4-209ENST00000460297 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa29.05■■■□□ 2.24
NME4-209ENST00000460297 GSTO1P78417 241 aa29.05■■■□□ 2.24
NME4-209ENST00000460297 DSCC1Q9BVC3 393 aa29.05■■■□□ 2.24
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NME4-209ENST00000460297 F8W031 263 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
NME4-209ENST00000460297 HSPA4P34932 840 aa29.05■■■□□ 2.24
NME4-209ENST00000460297 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
NME4-209ENST00000460297 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
NME4-209ENST00000460297 PSMD14O00487 310 aa29.04■■■□□ 2.24
NME4-209ENST00000460297 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
NME4-209ENST00000460297 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa29.04■■■□□ 2.24
NME4-209ENST00000460297 VIL1P09327 827 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
NME4-209ENST00000460297 NECTIN1Q15223 517 aa29.03■■■□□ 2.24
NME4-209ENST00000460297 KIF2CQ99661 725 aa29.03■■■□□ 2.24
NME4-209ENST00000460297 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP29.03■■■□□ 2.242e-6■■■□□ 18.9
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NME4-209ENST00000460297 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa29.03■■■□□ 2.24
NME4-209ENST00000460297 LDHCP07864 332 aa29.02■■■□□ 2.24
NME4-209ENST00000460297 CXCL9Q07325 125 aa29.02■■■□□ 2.24
NME4-209ENST00000460297 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
NME4-209ENST00000460297 KIAA0825Q8IV33 1275 aa29.02■■■□□ 2.24
NME4-209ENST00000460297 GAKO14976 1311 aa29.01■■■□□ 2.24
NME4-209ENST00000460297 PRKAB2O43741 272 aa29.01■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 MCCP23508 829 aa29.01■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 SCNN1DP51172 638 aa29■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 SLF2Q8IX21 1173 aa29■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa28.99■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa28.99■■■□□ 2.23
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NME4-209ENST00000460297 GSG1L2A8MUP6 293 aa28.99■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 GNAT2P19087 354 aa28.99■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 LMNB1P20700 586 aa28.99■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 PPP4CP60510 307 aa28.99■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 CREB3L3Q68CJ9 461 aa28.99■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 GMLQ99445 158 aa28.99■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 MYO3BQ8WXR4 1341 aa28.98■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 FZD9O00144 591 aa28.98■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 FGAP02671 866 aa28.98■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 CIAPIN1Q6FI81 312 aa28.98■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 RASEFQ8IZ41 740 aa28.98■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 KCNB2Q92953 911 aa28.98■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 SLC27A2O14975 620 aa28.97■■■□□ 2.23
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