RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460236.5

PHF20L1-211, Transcript of PHD finger protein 20 like 1, humanhuman

TSL 5

Gene PHF20L1, Length 3,393 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20L1-211ENST00000460236 LONRF3Q496Y0 759 aa6.73□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 SLC27A3Q5K4L6 730 aa6.73□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 SHANK3Q9BYB0 1731 aa6.73□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 MINDY4BA8MYZ0 360 aa6.73□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 CAPN15O75808 1086 aa6.73□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 RASEFQ8IZ41 740 aa6.73□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 OTUD6BQ8N6M0 293 aa6.73□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 STAP2Q9UGK3 403 aa6.73□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 TAF6LQ9Y6J9 622 aa6.73□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 RASGRF1Q13972 1273 aa6.72□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 LPIN2Q92539 896 aa6.72□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 AIDAQ96BJ3 306 aa6.72□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 NRAPQ86VF7 1730 aa6.72□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 CARMIL3Q8ND23 1372 aa6.72□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 SGSM2O43147 1006 aa6.72□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 ST18O60284 1047 aa6.72□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 ATP5JP18859 108 aa6.72□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 C2CD5Q86YS7 1000 aa6.72□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa6.72□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 CDHR2Q9BYE9 1310 aa6.72□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 CYP7A1P22680 504 aa6.72□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 SLC15A2Q16348 729 aa6.72□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 ADCK5Q3MIX3 580 aa6.72□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 NLGN1Q8N2Q7 840 aa6.72□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 ZBTB9Q96C00 473 aa6.72□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 OSBPL3Q9H4L5 887 aa6.72□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 ARMT1Q9H993 441 aa6.72□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 INCENPQ9NQS7 918 aa6.72□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 HMG20BQ9P0W2 317 aa6.72□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 NECAB1Q8N987 351 aa6.71□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 KBTBD3Q8NAB2 608 aa6.71□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 SPATA5Q8NB90 893 aa6.71□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 RNF217Q8TC41 542 aa6.71□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 MXD3Q9BW11 206 aa6.71□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 DBNDD1Q9H9R9 158 aa6.71□□□□□ -1.33
PHF20L1-211ENST00000460236 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
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PHF20L1-211ENST00000460236 SALL3Q9BXA9 1300 aa6.71□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 ZNF532Q9HCE3 1301 aa6.71□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 M0R2C6 588 aa6.71□□□□□ -1.34
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PHF20L1-211ENST00000460236 TDO2P48775 406 aa6.71□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 SDR42E1Q8WUS8 393 aa6.71□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 OSBP2Q969R2 916 aa6.71□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 CHAMP1Q96JM3 812 aa6.71□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 HAUS7Q99871 368 aa6.71□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 MROH5Q6ZUA9 1318 aa6.71□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 PRKAB2O43741 272 aa6.71□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 MBD4O95243 580 aa6.71□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 LMNB1P20700 586 aa6.71□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa6.71□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa6.71□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 TSPAN18Q96SJ8 248 aa6.71□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 ZNF804BA4D1E1 1349 aa6.7□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 SEMA3EO15041 775 aa6.7□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 PRDM1O75626 825 aa6.7□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 BDNFP23560 247 aa6.7□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 PRDX5P30044 214 aa6.7□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 MAP3K12Q12852 859 aa6.7□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 DIXDC1Q155Q3 683 aa6.7□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 KLF15Q9UIH9 416 aa6.7□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 NWD2Q9ULI1 1742 aa6.7□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 CCDC171Q6TFL3 1326 aa6.7□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa6.7□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 H0YIN7 160 aa6.7□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 GPAA1O43292 621 aa6.7□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 CIAO1O76071 339 aa6.7□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 RXRAP19793 462 aa6.7□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 SCNN1DP51172 638 aa6.7□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 GTF2IP78347 998 aa6.7□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 GPSM2P81274 684 aa6.7□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 PIBF1Q8WXW3 757 aa6.7□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.7□□□□□ -1.34
PHF20L1-211ENST00000460236 PLA2G12BQ9BX93 195 aa6.7□□□□□ -1.34
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