RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415548.1

CCT3-208, Transcript of chaperonin containing TCP1 subunit 3, human

TSL 3

Gene CCT3, Length 513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCT3-208	ENST00000415548	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	COG6	Q9Y2V7	657 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	AOC2	O75106	756 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	ECE1	P42892	770 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	CRK	P46108	304 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	CCDC102B	Q68D86	513 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	CEP85	Q6P2H3	762 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	XAGE2	Q96GT9	111 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	VEZT	Q9HBM0	779 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	MYO1B	O43795	1136 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	MOB2	Q70IA6	237 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	SEMA3E	O15041	775 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	RASGRF1	Q13972	1273 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	RGMB	Q6NW40	437 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	TEKT1	Q969V4	418 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	MAST3	O60307	1309 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	PRDX5	P30044	214 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	NF2	P35240	595 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	FKBP1B	P68106	108 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	PRKG1	Q13976	671 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	PDE3A	Q14432	1141 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	RASA3	Q14644	834 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	TNNI3K	Q59H18	835 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	GORAB	Q5T7V8	394 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	ZIC5	Q96T25	663 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	MRI	Q9BWK5	157 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	GPR108	Q9NPR9	543 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	WBP1L	Q9NX94	342 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	FZD1	Q9UP38	647 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CCT3-208	ENST00000415548	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	ZBTB22	O15209	634 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	FOXN1	O15353	648 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	MAP2K2	P36507	400 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	CACNB3	P54284	484 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	PI16	Q6UXB8	463 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	SLC10A3	P09131	477 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	NOG	Q13253	232 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	TNFAIP1	Q13829	316 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	SPATA5	Q8NB90	893 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	CCDC102A	Q96A19	550 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	AIDA	Q96BJ3	306 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	ABCF2	Q9UG63	623 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		10.31	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	MCAM	P43121	646 aa		10.31	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		10.31	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		10.31	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		10.31	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		10.31	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
CCT3-208	ENST00000415548	TEPSIN	Q96N21	525 aa		10.31	□□□□□ -0.76

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