RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403904.5

CSNK1E-204, Transcript of casein kinase 1 epsilon, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CSNK1E, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1E-204ENST00000403904 GLTPD2A6NH11 291 aa40.33■■■■■ 4.05
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CSNK1E-204ENST00000403904 MYH7P12883 1935 aa40.33■■■■■ 4.05
CSNK1E-204ENST00000403904 ZNF384Q8TF68 577 aa40.31■■■■■ 4.04
CSNK1E-204ENST00000403904 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP40.31■■■■■ 4.04
CSNK1E-204ENST00000403904 SCNN1DP51172 638 aa40.31■■■■■ 4.04
CSNK1E-204ENST00000403904 DPF2Q92785 391 aa40.31■■■■■ 4.04
CSNK1E-204ENST00000403904 CHGBP05060 677 aa40.3■■■■■ 4.04
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CSNK1E-204ENST00000403904 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa40.3■■■■■ 4.04
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CSNK1E-204ENST00000403904 OGFOD1Q8N543 542 aa40.27■■■■■ 4.04
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CSNK1E-204ENST00000403904 PDE6AP16499 860 aa40.27■■■■■ 4.04
CSNK1E-204ENST00000403904 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
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CSNK1E-204ENST00000403904 MICALL2Q8IY33 904 aa40.26■■■■■ 4.04
CSNK1E-204ENST00000403904 GPRC5DQ9NZD1 345 aa40.26■■■■■ 4.04
CSNK1E-204ENST00000403904 HDAC9Q9UKV0 1011 aa40.26■■■■■ 4.04
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CSNK1E-204ENST00000403904 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa40.22■■■■■ 4.03
CSNK1E-204ENST00000403904 EPS15P42566 896 aa40.22■■■■■ 4.03
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CSNK1E-204ENST00000403904 TEKT1Q969V4 418 aa40.22■■■■■ 4.03
CSNK1E-204ENST00000403904 SERPINA10Q9UK55 444 aa40.22■■■■■ 4.03
CSNK1E-204ENST00000403904 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
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CSNK1E-204ENST00000403904 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP40.2■■■■■ 4.03
CSNK1E-204ENST00000403904 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP40.2■■■■■ 4.032e-8■■■□□ 16.5
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CSNK1E-204ENST00000403904 H7C1D1 291 aa40.19■■■■■ 4.02
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CSNK1E-204ENST00000403904 FAM227BQ96M60 508 aa40.14■■■■■ 4.02
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CSNK1E-204ENST00000403904 SCN4AP35499 1836 aa40.14■■■■■ 4.02
CSNK1E-204ENST00000403904 POTECB2RU33 542 aa40.14■■■■■ 4.02
CSNK1E-204ENST00000403904 CHMLP26374 656 aa40.14■■■■■ 4.02
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CSNK1E-204ENST00000403904 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
CSNK1E-204ENST00000403904 MTMR14Q8NCE2 650 aa40.11■■■■■ 4.01
CSNK1E-204ENST00000403904 TRPM4Q8TD43 1214 aa40.11■■■■■ 4.01
CSNK1E-204ENST00000403904 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
CSNK1E-204ENST00000403904 IQCA1LA6NCM1 817 aa40.1■■■■■ 4.01
CSNK1E-204ENST00000403904 SPDYE2BA6NHP3 402 aa40.1■■■■■ 4.01
CSNK1E-204ENST00000403904 SPDYE6P0CI01 402 aa40.1■■■■■ 4.01
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