RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 ATP6V1AP38606 617 aa27.9■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 NBPF3Q9H094 633 aa27.9■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM177BA6PVY3 158 aa27.9■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 IDH1O75874 414 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 ARAP2Q8WZ64 1704 aa27.89■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 CARMIL3Q8ND23 1372 aa27.89■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 MROH5Q6ZUA9 1318 aa27.89■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF213O14771 459 aa27.89■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 LPIN2Q92539 896 aa27.89■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 AK7Q96M32 723 aa27.89■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 NRBP1Q9UHY1 535 aa27.89■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 CTAGE5O15320 804 aa27.88■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 LRMPQ12912 555 aa27.88■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 NCOA7Q8NI08 942 aa27.88■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP27.88■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 ITPK1Q13572 414 aa27.88■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 UBE3CQ15386 1083 aa27.88■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 CLIP2Q9UDT6 1046 aa27.88■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 RCOR1Q9UKL0 485 aa27.88■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 WWC3Q9ULE0 1092 aa27.88■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF532Q9HCE3 1301 aa27.87■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa27.87■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 SNAP23O00161 211 aa27.87■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 SIK1P57059 783 aa27.87■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 SARM1Q6SZW1 724 aa27.87■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKRD7Q92527 254 aa27.87■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 SEC31BQ9NQW1 1179 aa27.87■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 HPS5Q9UPZ3 1129 aa27.87■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 CAMTA2O94983 1202 aa27.87■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 PDE6AP16499 860 aa27.87■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 GUCY1B3Q02153 619 aa27.87■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 DENND2AQ9ULE3 1009 aa27.87■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 PHLPP1O60346 1717 aa27.87■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 RREB1Q92766 1687 aa27.86■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 ATL3Q6DD88 541 aa27.86■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 NKX2-3Q8TAU0 364 aa27.86■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa27.86■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa27.86■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 IQCB1Q15051 598 aa27.86■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa27.85■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa27.84■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 TBC1D10CQ8IV04 446 aa27.84■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 PDCL2Q8N4E4 241 aa27.84■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa27.84■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 STX1AQ16623 288 aa27.84■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 USP28Q96RU2 1077 aa27.84■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 GOLGA8BA8MQT2 603 aa27.83■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa27.83■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 CHMP4CQ96CF2 233 aa27.83■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 SPATA5Q8NB90 893 aa27.83■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 PRDM4Q9UKN5 801 aa27.83■■■□□ 2.05
AMIGO1-201ENST00000369862 SMTNL1A8MU46 457 aa27.82■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 RASGRF1Q13972 1273 aa27.82■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa27.82■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 WDR19Q8NEZ3 1342 aa27.82■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC5A1P13866 664 aa27.82■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 MPHOSPH8Q99549 860 aa27.82■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa27.81■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa27.81■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 SYCP1Q15431 976 aa27.81■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa27.81■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 DOCK2Q92608 1830 aa27.81■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 NTSR2O95665 410 aa27.8■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 APPP05067 770 aa27.8■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC144BQ3MJ40 725 aa27.8■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 PARP10Q53GL7 1025 aa27.8■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa27.8■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa27.8■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa27.8■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 NEMFO60524 1076 aa27.8■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 CYB5R4Q7L1T6 521 aa27.8■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa27.8■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP27.8■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 C4AP0C0L4 1744 aa27.79■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 C4BP0C0L5 1744 aa27.79■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 TNNT1P13805 278 aa27.79■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM160A1Q05DH4 1040 aa27.78■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 ENGASEQ8NFI3 743 aa27.78■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 COL4A1P02462 1669 aa27.78■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
AMIGO1-201ENST00000369862 KINO60870 393 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms