RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 CHD4Q14839 1912 aa21.32■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 ZBTB22O15209 634 aa21.32■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 HSPA4P34932 840 aa21.32■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 MAP4K1Q92918 833 aa21.32■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 AIDAQ96BJ3 306 aa21.32■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 PSMD1Q99460 953 aa21.32■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.31■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 GRIPAP1Q4V328 841 aa21.31■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 LCORLQ8N3X6 602 aa21.31■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 DIXDC1Q155Q3 683 aa21.29■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.29■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 LARGE2Q8N3Y3 721 aa21.29■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 COL4A5P29400 1685 aa21.29■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 FOXP2O15409 715 aa21.29■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 RASEFQ8IZ41 740 aa21.29■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 CERS5Q8N5B7 392 aa21.29■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa21.28■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 F8W031 263 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.28■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 PODNQ7Z5L7 613 aa21.28■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.28■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 DSCC1Q9BVC3 393 aa21.28■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 SNX14Q9Y5W7 946 aa21.28■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 NFKBIEO00221 500 aa21.27■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 SLC27A2O14975 620 aa21.27■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 NECTIN1Q15223 517 aa21.27■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.27■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 PRKAB2O43741 272 aa21.27■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 APPP05067 770 aa21.27■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 RASSF7Q02833 373 aa21.27■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 TAF6LQ9Y6J9 622 aa21.27■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 SCN9AQ15858 1988 aa21.27■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa21.26■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 YDJCA8MPS7 323 aa21.26■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP21.26■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa21.25■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.25■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 USP17L3A6NCW0 530 aa21.24■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 USP17L4A6NCW7 530 aa21.24■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 GSTO1P78417 241 aa21.24■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 USP17L1Q7RTZ2 530 aa21.24■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 NIM1KQ8IY84 436 aa21.24■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 ANAPC15P60006 121 aa21.23■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 DACT2Q5SW24 774 aa21.23■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.23■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 SYT17Q9BSW7 474 aa21.23■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa21.23■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa21.23■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 RAD17O75943 681 aa21.22■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 SCNN1DP51172 638 aa21.22■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 HAND2P61296 217 aa21.22■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 RABEP1Q15276 862 aa21.22■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 STRIP1Q5VSL9 837 aa21.22■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 RNF20Q5VTR2 975 aa21.22■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 SDR42E1Q8WUS8 393 aa21.22■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.22■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 FGAP02671 866 aa21.22■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 CYP21A2P08686 494 aa21.22■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 ADCK5Q3MIX3 580 aa21.22■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.21■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 SLC4A3P48751 1232 aa21.21■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 KIAA0825Q8IV33 1275 aa21.21■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 KCNB2Q92953 911 aa21.21■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
LTV1-201ENST00000367576 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
LTV1-201ENST00000367576 LDHCP07864 332 aa21.2■□□□□ 0.98
LTV1-201ENST00000367576 CPA1P15085 419 aa21.2■□□□□ 0.98
LTV1-201ENST00000367576 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
LTV1-201ENST00000367576 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
LTV1-201ENST00000367576 GNAT2P19087 354 aa21.2■□□□□ 0.98
LTV1-201ENST00000367576 BTDP43251 543 aa21.2■□□□□ 0.98
LTV1-201ENST00000367576 PRELPP51888 382 aa21.2■□□□□ 0.98
LTV1-201ENST00000367576 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.2■□□□□ 0.98
LTV1-201ENST00000367576 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
LTV1-201ENST00000367576 CTNNA3Q9UI47 895 aa21.2■□□□□ 0.98
LTV1-201ENST00000367576 MYH2Q9UKX2 1941 aa21.19■□□□□ 0.98
LTV1-201ENST00000367576 TDO2P48775 406 aa21.19■□□□□ 0.98
LTV1-201ENST00000367576 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
LTV1-201ENST00000367576 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
LTV1-201ENST00000367576 NAPBQ9H115 298 aa21.19■□□□□ 0.98
LTV1-201ENST00000367576 VPS33BQ9H267 617 aa21.19■□□□□ 0.98
LTV1-201ENST00000367576 ZNRF3Q9ULT6 936 aa21.19■□□□□ 0.98
LTV1-201ENST00000367576 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa21.19■□□□□ 0.98
LTV1-201ENST00000367576 PSMD14O00487 310 aa21.18■□□□□ 0.98
LTV1-201ENST00000367576 CASTP20810 708 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms