RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRC-202ENST00000367364 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
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PTPRC-202ENST00000367364 GSTM4Q03013 218 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRC-202ENST00000367364 CTSBP07858 339 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRC-202ENST00000367364 C8orf34Q49A92 452 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRC-202ENST00000367364 DUSP27Q5VZP5 1158 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRC-202ENST00000367364 ASAP3Q8TDY4 903 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRC-202ENST00000367364 SEMA6CQ9H3T2 930 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRC-202ENST00000367364 ATG7O95352 703 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRC-202ENST00000367364 RAB6AP20340 208 aa9.42□□□□□ -0.9
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PTPRC-202ENST00000367364 SPRED2Q7Z698 418 aa9.42□□□□□ -0.9
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PTPRC-202ENST00000367364 EDN3P14138 238 aa9.4□□□□□ -0.9
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PTPRC-202ENST00000367364 TNFRSF21O75509 655 aa9.39□□□□□ -0.91
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PTPRC-202ENST00000367364 PHACTR2O75167 634 aa9.38□□□□□ -0.91
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PTPRC-202ENST00000367364 A0A1W2PPZ6 126 aa9.3□□□□□ -0.92
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PTPRC-202ENST00000367364 GRIA4P48058 902 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRC-202ENST00000367364 SPRED3Q2MJR0 410 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRC-202ENST00000367364 CCNJLQ8IV13 435 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRC-202ENST00000367364 RAD18Q9NS91 495 aa9.29□□□□□ -0.92
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PTPRC-202ENST00000367364 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PTPRC-202ENST00000367364 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa9.27□□□□□ -0.93
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