RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 FBXL16Q8N461 479 aa20.09■□□□□ 0.81
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PDE4A-201ENST00000293683 LAMB4A4D0S4 1761 aa20.09■□□□□ 0.81
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PDE4A-201ENST00000293683 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa20.08■□□□□ 0.81
PDE4A-201ENST00000293683 ERO1AQ96HE7 468 aa20.08■□□□□ 0.81
PDE4A-201ENST00000293683 HSD3B7Q9H2F3 369 aa20.08■□□□□ 0.81
PDE4A-201ENST00000293683 IMPACTQ9P2X3 320 aa20.08■□□□□ 0.81
PDE4A-201ENST00000293683 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PDE4A-201ENST00000293683 COL18A1P39060 1754 aa20.08■□□□□ 0.81
PDE4A-201ENST00000293683 SLU7O95391 586 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 NLRP12P59046 1061 aa20.08■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 BPIFA3Q9BQP9 254 aa20.08■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 KCND1Q9NSA2 647 aa20.08■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 NUP188Q5SRE5 1749 aa20.08■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 CIAO1O76071 339 aa20.07■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.07■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 CCDC191Q8NCU4 936 aa20.07■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 NBPF3Q9H094 633 aa20.07■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 BRAPQ7Z569 592 aa20.07■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
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PDE4A-201ENST00000293683 KIF20AO95235 890 aa20.06■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 GOLGA8FQ08AF8 430 aa20.06■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa20.06■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa20.06■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 NCOA7Q8NI08 942 aa20.06■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 DPF2Q92785 391 aa20.06■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 SENP2Q9HC62 589 aa20.06■□□□□ 0.8
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PDE4A-201ENST00000293683 CCDC150Q8NCX0 1101 aa20.06■□□□□ 0.8
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PDE4A-201ENST00000293683 UBE2Q2LH0YL09 131 aa20.05■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 FANCCQ00597 558 aa20.05■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF446Q9NWS9 450 aa20.05■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 TMEM94Q12767 1356 aa20.05■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF213O14771 459 aa20.05■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 CMA1P23946 247 aa20.05■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 APPBP2Q92624 585 aa20.05■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 PHKBQ93100 1093 aa20.05■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 PKD1L3Q7Z443 1732 aa20.05■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
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PDE4A-201ENST00000293683 SYNE4Q8N205 404 aa20.04■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 FAM89AQ96GI7 184 aa20.04■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 CLIC6Q96NY7 704 aa20.04■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 C19orf44Q9H6X5 657 aa20.04■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 SPEF2Q9C093 1822 aa20.04■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 SHC4Q6S5L8 630 aa20.04■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 CYB5R4Q7L1T6 521 aa20.04■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 VPS37DQ86XT2 251 aa20.04■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 TBC1D10CQ8IV04 446 aa20.04■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.04■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 MST1RQ04912 1400 aa20.04■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 SLC39A14Q15043 492 aa20.03■□□□□ 0.8
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PDE4A-201ENST00000293683 SLFN14P0C7P3 912 aa20.03■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 SYKP43405 635 aa20.03■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 TICAM2Q86XR7 235 aa20.03■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 ATG3Q9NT62 314 aa20.03■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 FANCGO15287 622 aa20.02■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 KRT222Q8N1A0 295 aa20.02■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 C4AP0C0L4 1744 aa20.02■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 C4BP0C0L5 1744 aa20.02■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 ADAMTSL3P82987 1691 aa20.02■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 CDC27P30260 824 aa20.02■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 MCAMP43121 646 aa20.02■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa20.02■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 MICU3Q86XE3 530 aa20.02■□□□□ 0.8
PDE4A-201ENST00000293683 MYL10Q9BUA6 226 aa20.02■□□□□ 0.8
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PDE4A-201ENST00000293683 TMEM232C9JQI7 657 aa20.01■□□□□ 0.79
PDE4A-201ENST00000293683 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
PDE4A-201ENST00000293683 CCDC93Q567U6 631 aa20.01■□□□□ 0.79
PDE4A-201ENST00000293683 KRT40Q6A162 431 aa20.01■□□□□ 0.79
PDE4A-201ENST00000293683 INCENPQ9NQS7 918 aa20.01■□□□□ 0.79
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PDE4A-201ENST00000293683 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP20.01■□□□□ 0.79
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PDE4A-201ENST00000293683 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.01■□□□□ 0.79
PDE4A-201ENST00000293683 HOMER1Q86YM7 354 aa20.01■□□□□ 0.79
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PDE4A-201ENST00000293683 HPSEQ9Y251 543 aa20■□□□□ 0.79
PDE4A-201ENST00000293683 ZMYM6O95789 1325 aa20■□□□□ 0.79
PDE4A-201ENST00000293683 KCPQ6ZWJ8 1503 aa20■□□□□ 0.79
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PDE4A-201ENST00000293683 PTPAQ15257 358 aa20■□□□□ 0.79
PDE4A-201ENST00000293683 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
PDE4A-201ENST00000293683 ISCA1Q9BUE6 129 aa20■□□□□ 0.79
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PDE4A-201ENST00000293683 TUBE1Q9UJT0 475 aa20■□□□□ 0.79
PDE4A-201ENST00000293683 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20■□□□□ 0.79
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