RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287543.4

MALSU1-201, Transcript of mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene MALSU1, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa23.41■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 A0A1B0GUL6 1792 aa23.41■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 SLC10A3P09131 477 aa23.4■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 RLBP1P12271 317 aa23.4■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 TNNI2P48788 182 aa23.4■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 TFCP2Q12800 502 aa23.4■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 POLA2Q14181 598 aa23.4■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 HHIPL2Q6UWX4 724 aa23.4■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 A0A1B0GUL7 405 aa23.39■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 UNCXA6NJT0 531 aa23.39■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 UBE2Q2LH0YL09 131 aa23.39■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 TIMM10P62072 90 aa23.39■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 CCDC102BQ68D86 513 aa23.39■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 SSH3Q8TE77 659 aa23.39■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 ZDHHC15Q96MV8 337 aa23.39■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.39■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 SALL1Q9NSC2 1324 aa23.38■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 PHKA1P46020 1223 aa23.38■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 RASA3Q14644 834 aa23.38■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 IFFO2Q5TF58 517 aa23.38■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 TMOD2Q9NZR1 351 aa23.38■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 GRIK5Q16478 980 aa23.37■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 XAGE2Q96GT9 111 aa23.37■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.37■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 LBX1P52954 281 aa23.36■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 MAP3K11Q16584 847 aa23.36■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 GORABQ5T7V8 394 aa23.36■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 RASAL3Q86YV0 1011 aa23.36■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 GPR108Q9NPR9 543 aa23.36■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 ADORA1P30542 326 aa23.35■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 LDLRAD1Q5T700 205 aa23.35■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 FKBP1CQ5VVH2 108 aa23.35■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 MOB2Q70IA6 237 aa23.35■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 TNS4Q8IZW8 715 aa23.35■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 PANK1Q8TE04 598 aa23.35■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.35■■□□□ 1.33
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MALSU1-201ENST00000287543 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 SLF2Q8IX21 1173 aa23.34■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.34■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 THSD7BQ9C0I4 1608 aa23.33■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 IREB2P48200 963 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 PRKG1Q13976 671 aa23.33■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
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MALSU1-201ENST00000287543 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.33■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 SAGE1Q9NXZ1 904 aa23.33■■□□□ 1.33
MALSU1-201ENST00000287543 AOX1Q06278 1338 aa23.33■■□□□ 1.32
MALSU1-201ENST00000287543 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.32■■□□□ 1.32
MALSU1-201ENST00000287543 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa23.32■■□□□ 1.32
MALSU1-201ENST00000287543 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
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MALSU1-201ENST00000287543 ZIC5Q96T25 663 aa23.32■■□□□ 1.32
MALSU1-201ENST00000287543 RASGRF1Q13972 1273 aa23.31■■□□□ 1.32
MALSU1-201ENST00000287543 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.31■■□□□ 1.32
MALSU1-201ENST00000287543 CSRNP1Q96S65 589 aa23.31■■□□□ 1.32
MALSU1-201ENST00000287543 PRDX5P30044 214 aa23.3■■□□□ 1.32
MALSU1-201ENST00000287543 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa23.3■■□□□ 1.32
MALSU1-201ENST00000287543 CEP85Q6P2H3 762 aa23.3■■□□□ 1.32
MALSU1-201ENST00000287543 PDE3AQ14432 1141 aa23.29■■□□□ 1.32
MALSU1-201ENST00000287543 CCDC158Q5M9N0 1113 aa23.29■■□□□ 1.32
MALSU1-201ENST00000287543 ERC1Q8IUD2 1116 aa23.29■■□□□ 1.32
MALSU1-201ENST00000287543 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
MALSU1-201ENST00000287543 ABCF2Q9UG63 623 aa23.29■■□□□ 1.32
MALSU1-201ENST00000287543 PCNTO95613 3336 aa23.28■■□□□ 1.32
MALSU1-201ENST00000287543 SREBF2Q12772 1141 aa23.28■■□□□ 1.32
MALSU1-201ENST00000287543 TNNI3KQ59H18 835 aa23.28■■□□□ 1.32
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MALSU1-201ENST00000287543 TEPSINQ96N21 525 aa23.28■■□□□ 1.32
MALSU1-201ENST00000287543 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa23.28■■□□□ 1.32
MALSU1-201ENST00000287543 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.28■■□□□ 1.32
MALSU1-201ENST00000287543 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
MALSU1-201ENST00000287543 HMMRO75330 724 aa23.27■■□□□ 1.32
MALSU1-201ENST00000287543 USP2O75604 605 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
MALSU1-201ENST00000287543 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
MALSU1-201ENST00000287543 INHBEP58166 350 aa23.27■■□□□ 1.32
MALSU1-201ENST00000287543 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.27■■□□□ 1.32
MALSU1-201ENST00000287543 SPATA5Q8NB90 893 aa23.27■■□□□ 1.32
MALSU1-201ENST00000287543 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
MALSU1-201ENST00000287543 TMEM39BQ9GZU3 492 aa23.27■■□□□ 1.32
MALSU1-201ENST00000287543 COG6Q9Y2V7 657 aa23.27■■□□□ 1.32
MALSU1-201ENST00000287543 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
MALSU1-201ENST00000287543 IGSF3O75054 1194 aa23.26■■□□□ 1.31
MALSU1-201ENST00000287543 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
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