RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
UBE2B-201ENST00000265339 RUFY2Q8WXA3 655 aa24.14■■□□□ 1.46
UBE2B-201ENST00000265339 MCM5P33992 734 aa24.13■■□□□ 1.45
UBE2B-201ENST00000265339 TGFB2P61812 414 aa24.13■■□□□ 1.45
UBE2B-201ENST00000265339 TTLL6Q8N841 843 aa24.13■■□□□ 1.45
UBE2B-201ENST00000265339 SNED1Q8TER0 1413 aa24.13■■□□□ 1.45
UBE2B-201ENST00000265339 SEMA3EO15041 775 aa24.13■■□□□ 1.45
UBE2B-201ENST00000265339 TICAM2Q86XR7 235 aa24.13■■□□□ 1.45
UBE2B-201ENST00000265339 DENND2AQ9ULE3 1009 aa24.13■■□□□ 1.45
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF804AQ7Z570 1209 aa24.12■■□□□ 1.45
UBE2B-201ENST00000265339 USP26Q9BXU7 913 aa24.12■■□□□ 1.45
UBE2B-201ENST00000265339 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.12■■□□□ 1.45
UBE2B-201ENST00000265339 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
UBE2B-201ENST00000265339 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
UBE2B-201ENST00000265339 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
UBE2B-201ENST00000265339 RABEP1Q15276 862 aa24.12■■□□□ 1.45
UBE2B-201ENST00000265339 RAD50Q92878 1312 aa24.12■■□□□ 1.45
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UBE2B-201ENST00000265339 IDH1O75874 414 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
UBE2B-201ENST00000265339 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC39Q9UFE4 941 aa24.11■■□□□ 1.45
UBE2B-201ENST00000265339 KLHL34Q8N239 644 aa24.1■■□□□ 1.45
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UBE2B-201ENST00000265339 C21orf2O43822 256 aa24.1■■□□□ 1.45
UBE2B-201ENST00000265339 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa24.1■■□□□ 1.45
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
UBE2B-201ENST00000265339 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
UBE2B-201ENST00000265339 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP24.1■■□□□ 1.45
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UBE2B-201ENST00000265339 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.09■■□□□ 1.45
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UBE2B-201ENST00000265339 CD209Q9NNX6 404 aa24.09■■□□□ 1.45
UBE2B-201ENST00000265339 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
UBE2B-201ENST00000265339 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.09■■□□□ 1.45
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UBE2B-201ENST00000265339 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
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UBE2B-201ENST00000265339 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
UBE2B-201ENST00000265339 SPON1Q9HCB6 807 aa24.08■■□□□ 1.44
UBE2B-201ENST00000265339 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa24.07■■□□□ 1.44
UBE2B-201ENST00000265339 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa24.07■■□□□ 1.44
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa24.07■■□□□ 1.44
UBE2B-201ENST00000265339 HELLSQ9NRZ9 838 aa24.07■■□□□ 1.44
UBE2B-201ENST00000265339 PIM2Q9P1W9 311 aa24.07■■□□□ 1.44
UBE2B-201ENST00000265339 JAG2Q9Y219 1238 aa24.07■■□□□ 1.44
UBE2B-201ENST00000265339 IL1R1P14778 569 aa24.07■■□□□ 1.44
UBE2B-201ENST00000265339 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa24.07■■□□□ 1.44
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UBE2B-201ENST00000265339 TSC1Q92574 1164 aa24.05■■□□□ 1.44
UBE2B-201ENST00000265339 APPBP2Q92624 585 aa24.05■■□□□ 1.44
UBE2B-201ENST00000265339 CHD4Q14839 1912 aa24.05■■□□□ 1.44
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UBE2B-201ENST00000265339 M0R2C6 588 aa24.05■■□□□ 1.44
UBE2B-201ENST00000265339 EYA3Q99504 573 aa24.05■■□□□ 1.44
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC171Q6TFL3 1326 aa24.04■■□□□ 1.44
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF532Q9HCE3 1301 aa24.04■■□□□ 1.44
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UBE2B-201ENST00000265339 UBE3CQ15386 1083 aa24.04■■□□□ 1.44
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC93Q567U6 631 aa24.04■■□□□ 1.44
UBE2B-201ENST00000265339 MAGEB6Q8N7X4 407 aa24.04■■□□□ 1.44
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UBE2B-201ENST00000265339 NUCB2P80303 420 aa24.03■■□□□ 1.44
UBE2B-201ENST00000265339 MYRIPQ8NFW9 859 aa24.03■■□□□ 1.44
UBE2B-201ENST00000265339 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
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UBE2B-201ENST00000265339 MAST2Q6P0Q8 1798 aa24.02■■□□□ 1.44
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UBE2B-201ENST00000265339 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.02■■□□□ 1.44
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UBE2B-201ENST00000265339 RAI14Q9P0K7 980 aa24.02■■□□□ 1.44
UBE2B-201ENST00000265339 SALL1Q9NSC2 1324 aa24.01■■□□□ 1.43
UBE2B-201ENST00000265339 SYCE3A1L190 88 aa24.01■■□□□ 1.43
UBE2B-201ENST00000265339 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.01■■□□□ 1.43
UBE2B-201ENST00000265339 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa24.01■■□□□ 1.43
UBE2B-201ENST00000265339 RNF214Q8ND24 703 aa24.01■■□□□ 1.43
UBE2B-201ENST00000265339 WDR66Q8TBY9 1149 aa24.01■■□□□ 1.43
UBE2B-201ENST00000265339 PRDX5P30044 214 aa24.01■■□□□ 1.43
UBE2B-201ENST00000265339 GRIPAP1Q4V328 841 aa24.01■■□□□ 1.43
UBE2B-201ENST00000265339 RTKN2Q8IZC4 609 aa24.01■■□□□ 1.43
UBE2B-201ENST00000265339 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
UBE2B-201ENST00000265339 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
UBE2B-201ENST00000265339 PDE4CQ08493 712 aa24■■□□□ 1.43
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